Back to Search Start Over

Genetic population structure and demography of an apex predator, the tiger shark Galeocerdo cuvier

Authors :
Pirog, Agathe
Jaquemet, Sébastien
Ravigné, Virginie
Cliff, Geremy
Clua, Eric
Holmes, Bonnie
Hussey, Nigel
Nevill, John E. G.
Temple, Andrew
Berggren, Per
Vigliola, Laurent
Magalon, Hélène
Ecologie marine tropicale dans les Océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Réunion])
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Laboratoire d'Ecologie Marine (ECOMAR)
Université de La Réunion (UR)
Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Biomedical Resource Unit
University of KwaZulu-Natal (UKZN)
Laboratoire d'Excellence CORAIL (LabEX CORAIL)
Université des Antilles (UA)-Institut d'écologie et environnement-Université de la Nouvelle Calédonie (UNC)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Université de La Réunion (UR)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-École pratique des hautes études (EPHE)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Centre for Marine Science, School of Biological Sciences, University of Queensland
University of Queensland [Brisbane]
University of Windsor [Ca]
School of Natural and Environmental Sciences
Newcastle University [Newcastle]
School of Marine Science and Technology
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR)
Université des Antilles (UA)-Institut d'écologie et environnement-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Université de La Réunion (UR)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE)
Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie])
Ifremer - Nouvelle-Calédonie
Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
University of KwaZulu-Natal [Durban, Afrique du Sud] (UKZN)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de La Réunion (UR)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC)-Institut d'écologie et environnement-Université des Antilles (UA)
Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Ifremer - Nouvelle-Calédonie
Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC)
Source :
Ecology and Evolution, Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2019, 9 (10), pp.5551-5571. ⟨10.1002/ece3.5111⟩, Ecology and Evolution, Vol 9, Iss 10, Pp 5551-5571 (2019), Ecology and Evolution, 2019, 9 (10), pp.5551-5571. ⟨10.1002/ece3.5111⟩
Publication Year :
2019
Publisher :
John Wiley and Sons Inc., 2019.

Abstract

International audience; Population genetics has been increasingly applied to study large sharks over the last decade. Whilst large shark species are often difficult to study with direct methods, improved knowledge is needed for both population management and conservation, especially for species vulnerable to anthropogenic and climatic impacts. The tiger shark, Galeocerdo cuvier, is an apex predator known to play important direct and indirect roles in tropical and subtropical marine ecosystems. While the global and Indo‐West Pacific population genetic structure of this species has recently been investigated, questions remain over population structure and demographic history within the western Indian (WIO) and within the western Pacific Oceans (WPO). To address the knowledge gap in tiger shark regional population structures, the genetic diversity of 286 individuals sampled in seven localities was investigated using 27 microsatellite loci and three mitochondrial genes (CR, COI, and cytb). A weak genetic differentiation was observed between the WIO and the WPO, suggesting high genetic connectivity. This result agrees with previous studies and highlights the importance of the pelagic behavior of this species to ensure gene flow. Using approximate Bayesian computation to couple information from both nuclear and mitochondrial markers, evidence of a recent bottleneck in the Holocene (2,000–3,000 years ago) was found, which is the most probable cause for the low genetic diversity observed. A contemporary effective population size as low as 111 [43,369] was estimated during the bottleneck. Together, these results indicate low genetic diversity that may reflect a vulnerable population sensitive to regional pressures. Conservation measures are thus needed to protect a species that is classified as Near Threatened.

Details

Language :
English
ISSN :
20457758
Volume :
9
Issue :
10
Database :
OpenAIRE
Journal :
Ecology and Evolution
Accession number :
edsair.pmid.dedup....4169eb162b75a93320376a55c31186c2