Contribution à l'étude génétique du cacaoyer par les marqueurs moléculaires : diversité génétique et recherche de QTLs

Les marqueurs RAPD ont été développés pour étudier la diversité génétique et la cartographie du cacaoyer à cause de leur simplicité et des possibilités de transfert de technologie qu'ils offrent. Ils ont permis de classer les génotypes étudiés en trois grands groupes qui sont les Forastero Bas Amazoniens, les Forastero Haut Amazoniens et les Criollo, en accord avec la classification morphogéographique. Ils se présentent ainsi comme un outil efficace de classification. L'étude des paramètres génétiques de la diversité révélée par les RFLP a mis en évidence une grande diversité génique au sein des cacaoyers et a révélée une grande richesse allélique au sein de la population de la Haute Amazonie . Tous les groupes présentent des déséquilibres dus au système de reproduction mais aussi à la présence très probable de sous populations. Les groupes les plus éloignés sont les Criollo et les Forastero Haut Amazoniens. Cependant une forte différenciation génétique a été mise en évidence entre les Forastero Haut Amazoniens et les Forastero Bas Amazoniens. La recherche de QTL pour les caractères morphologiques et ceux de la résistance au Phytophthora a permis de localiser des régions chromosomiques impliquées dans l'expression de certains des caractères étudiés. Ainsi, des QTL de la résistance au Phytophthora ont été mis en évidence sur les groupes de liaison 1 et 8. Différentes régions chromosomiques ont été mises en évidence pour les caractères mésurés à Divo et à Bingerville