Back to Search Start Over

Análisis de genómica comparativa: del virus SARS al SAR SCoV- 2. Similitudes y diferencias

Authors :
Irma Berenice Mulato-Briones
Rosa María Ribas-Aparicio
Abraham Reyes-Gastellou
Ismael Olan Rodríguez-Ildefonso
Mauricio Salcedo-Vargas
Source :
Instituto Politécnico Nacional, IPN, Redalyc-IPN, Revista Médica del Instituto Mexicano del Seguro Social (México) Num.2 Vol.58
Publication Year :
2020
Publisher :
Instituto Mexicano del Seguro Social, 2020.

Abstract

"Introducción: en este momento somos testigos de un evento de magnitud mundial provocado por el brote pandémico derivado del nuevo virus SARS-CoV-2, lo cual requiere la generación de conocimiento. Por lo novedoso que resulta, muchas hipótesis y teorías son discutidas a diario respecto al origen de este nuevo virus. Varios estudios están enfocados en demostrar la similitud que el SARS-CoV-2 tiene con otros virus. Objetivo: resaltar las diferencias del SARS-CoV-2 con otros virus SARS, a partir de un análisis de genómica comparativa, y determinar si se pueden atribuir a eventos de manipulación. Material y métodos: se descargaron dos genomas completos de virus SARS, seis genomas completos de coronavirus humanos y 16 de coronavirus tipo SARS; fueron analizados en un estudio de genómica comparativa mediante la herramienta BLAST Ring Image Generator, y a continuación se examinaron las diferencias evidentes mediante el uso de los programas MAFFT y BLAST. Resultados: se observó una alta identidad en fragmentos de los genomas tipo SARS de mamíferos con los genomas SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2, y se identificaron tres diferencias nucleotídicas principales: en el gen ORF1ab región nsp3, en el gen S de reconocimiento al receptor y en el gen ORF8, con el cual se pueden separar las cepas tipo SARS de mamíferos en tipo SARS-CoV-1 y SARS-CoV-2. Conclusión: el genoma completo de SARS-CoV-2 posee una alta identidad con cepas tipo SARS de mamíferos, por lo que su aparición más probable podría ser el resultado de la evolución natural."

Details

Language :
Spanish; Castilian
Database :
OpenAIRE
Journal :
Instituto Politécnico Nacional, IPN, Redalyc-IPN, Revista Médica del Instituto Mexicano del Seguro Social (México) Num.2 Vol.58
Accession number :
edsair.od......3056..6c0f31753cf95689fd5df26e13b9373e