État des lieux des prescriptions des analyses virologiques sur les prélèvements de liquides céphalorachidiens et optimisation de leur prise en charge au laboratoire de virologie du CHU de Caen

We introduce this work with an update of the epidemiology concerning the many viral agents responsible for central nervous system (CNS) infections. The first part describes the circuit of a cerebrospinal fluid (CSF) sample in the CHU of Caen, from the collection to the analysis in the virology laboratory. We describe the results of these analysis between January 1st 2015 and December 31th 2016, and the prescriptions from the different care departments. The second part of this work reports a comparison of 2 RT-PCR method used for the detection of enteroviruses in the CSF, and an evaluation of a multiplex PCR for the detection of 14 pathogens agents involved in infectious meningitis and encephalitis.; L’introduction de cette thèse est une actualisation des données épidémiologiques concernant les nombreuses étiologies virales des infections du système nerveux central. La première partie décrit le parcours d’un échantillon de liquide céphalorachidien (LCR) au sein du CHU de Caen, de son prélèvement dans le service de soins, jusqu’à la réalisation des analyses de virologie. Nous décrivons aussi les résultats de ces analyses entre le 1er janvier 2015 et le 31 décembre 2016, ainsi que les prescriptions des différents services de soins. La seconde partie concerne la comparaison de deux méthodes de RT-PCR pour la détection des entérovirus dans le LCR, ainsi que l’évaluation d’une PCR Multiplex pour la détection de 14 micro-organismes impliqués dans les méningites et encéphalites infectieuses.