Etude de l'influence de l'hydromorphie des sols sur les communautés microbiennes à l'échelle d'un versant agricole

Rapport de stage de Master 1, Spécialité Sciences de l'Environnement EA EcolDur GenoSol CT?; Le projet MOSAIC vise à étudier les facteurs contrôlant la dynamique des MOS à l’échelle d’un paysage agricole dans un contexte de durabilité des systèmes culturaux. Le but du stage était d’étudier l’impact du gradient d’hydromorphie sur les communautés microbiennes des sols à l’échelle d’un versant agricole du site d’étude de MOSAIC. Les échantillons de sol étudiés sont issus de campagnes de prélèvement datant du 28 mars et du 21 mai 2013. Les analyses en laboratoire ont démontré la présence effective d’un gradient d’humidité croissant du haut vers le bas de versant ainsi que des différences dans les valeurs de respiration hétérotrophe de ces sols. Par la suite, l’étude a mis en évidence des différences de quantité d’ADN microbien des sols donc de taille des populations microbiennes des sols ainsi que des différences dans la structure génétique des communautés bactériennes et fongiques via la technique de PCR-ARISA. La zone de bas de versant, avec ses caractéristiques de sol (humidité, teneur en carbone, structure) constitue un habitat écologique spécifique.