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Identification of associations between clinical signs and hosts to monitor the web for detection of animal disease outbreaks

Authors :
Pascal Hendrikx
Barbara Dufour
Sylvain Falala
Mathieu Roche
David Chavernac
Elena Arsevska
Renaud Lancelot
Contrôle des maladies animales exotiques et émergentes (UMR CMAEE)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale (UMR TETIS)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)
AgroParisTech
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Unit Coordinat & Support Surveillance UCAS
Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)
École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source :
International Journal of Agricultural and Environmental Information Systems, International Journal of Agricultural and Environmental Information Systems, IGI Global, 2016, 7 (3), pp.1-20. ⟨10.4018/ijaeis.2016070101⟩
Publication Year :
2016
Publisher :
HAL CCSD, 2016.

Abstract

In a context of intensification of international trade and travels, the transboundary spread of emerging human or animal pathogens represents a growing concern. One of the missions of the national veterinary services is to implement international epidemiological intelligence for a timely and accurate detection of emerging animal infectious diseases (EAID) worldwide, and take early actions to prevent their introduction on the national territory. For this purpose, an efficient use of the information published on the web is essential. The authors present a comprehensive method for identification of relevant associations between terms describing clinical signs and hosts to build queries to monitor the web for early detection of EAID. Using text and web mining approaches, they present statistical measures for automatic selection of relevant associations between terms. In addition, expert elicitation is used to highlight the most relevant terms and associations among those automatically selected. The authors assessed the performance of the combination of the automatic approach and expert elicitation to monitor the web for a list of selected animal pathogens. (Resume d'auteur)

Details

Language :
English
ISSN :
19473192 and 19473206
Database :
OpenAIRE
Journal :
International Journal of Agricultural and Environmental Information Systems, International Journal of Agricultural and Environmental Information Systems, IGI Global, 2016, 7 (3), pp.1-20. ⟨10.4018/ijaeis.2016070101⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....fd9f9b258741a64fd8d26b6b3109e878
Full Text :
https://doi.org/10.4018/ijaeis.2016070101⟩