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Improvement of FISH mapping resolution on combed DNA molecules by iterative constrained deconvolution: a quantitative study

Authors :
Claire Vourc'h
Claire Rougeulle
Y. Usson
Aaron Bensimon
Edith Heard
L. Heliot
M. Robert-Nicoud
K. Monier
Centre épigénétique et destin cellulaire (EDC (UMR_7216))
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)
Biologie moléculaire et cellulaire de la différenciation
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Albert Bonniot-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Génétique Moléculaire Murine
Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Biophysique de l'ADN
Institut Pasteur [Paris] (IP)
RFMQ
Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur [Paris]
Institut Pasteur [Paris]
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Source :
Cytogenetic and Genome Research, Cytogenetic and Genome Research, Karger, 2001, 92 (1-2), pp.59-62. ⟨10.1159/000056869⟩, Scopus-Elsevier, Cytogenetics and Cell Genetics, Cytogenetics and Cell Genetics, 2001, 92 (1-2), pp.59-62. ⟨10.1159/000056869⟩, Cytogenetics and Cell Genetics, S Karger AG, 2001, 92 (1-2), pp.59-62. ⟨10.1159/000056869⟩
Publication Year :
2001
Publisher :
HAL CCSD, 2001.

Abstract

Image restoration approaches, such as digital deconvolution, are becoming widely used for improving the quality of microscopic images. However, no quantification of the gain in resolution of fluorescence images is available. We show that, after iterative constrained deconvolution, fluorescent cosmid signals appear to be 25% smaller, and 1.2-kb fragment signals on combed molecules faithfully display the expected length.

Details

Language :
English
ISSN :
14248581, 1424859X, 03010171, and 14219816
Database :
OpenAIRE
Journal :
Cytogenetic and Genome Research, Cytogenetic and Genome Research, Karger, 2001, 92 (1-2), pp.59-62. ⟨10.1159/000056869⟩, Scopus-Elsevier, Cytogenetics and Cell Genetics, Cytogenetics and Cell Genetics, 2001, 92 (1-2), pp.59-62. ⟨10.1159/000056869⟩, Cytogenetics and Cell Genetics, S Karger AG, 2001, 92 (1-2), pp.59-62. ⟨10.1159/000056869⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....f98cdc936efecdab1ce5a79c9dc87f52
Full Text :
https://doi.org/10.1159/000056869⟩