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Mitochondrial DNA polymorphism and heteroplasmy in populations of the three species of Tropidurus of the nanuzae group (Squamata, Tropiduridae)
- Source :
- Genetics and Molecular Biology v.23 n.2 2000, Genetics and Molecular Biology, Sociedade Brasileira de Genética (SBG), instacron:SBG, Genetics and Molecular Biology, Volume: 23, Issue: 2, Pages: 351-356, Published: JUN 2000, Genetics and Molecular Biology, Vol 23, Iss 2, Pp 351-356 (2000)
- Publication Year :
- 2000
- Publisher :
- Sociedade Brasileira de Genética, 2000.
-
Abstract
- The nanuzae group of lizards includes three species, Tropidurus nanuzae, T. divaricatus and T. amathites. The first species is found along Serra do Espinhaço, in eastern Brazil, and the other two in the northern region of the Brazilian State of Bahia, in continental dunes on both margins of the São Francisco River. Restriction fragment length polymorphisms (RFLP) of the mtDNA in these species were detected in 53 restriction sites. Site and fragment length polymorphisms were characterized, and cases of heteroplasmy involving length variation were observed. In T. divaricatus, these variations involved changes of 50-200 bp, probably in the control region of the molecule. In T. amathites, variation was apparently due to duplication/deletion of a 400-bp segment. Fragment length mutation rate varied among the species, being smaller in T. amathites than in T. divaricatus. Relatively low nucleotide diversity values were detected in these populations, the smallest being found in T. nanuzae. The most polymorphic population was T. divaricatus from Alagoado, followed by that of the same species from Ibiraba, suggesting both probable recovery of mtDNA genetic diversity after putative reductions in population size, and recent population expansion.O grupo nanuzae de lagartos compreende três espécies, Tropidurus nanuzae, T. divaricatus e T. amathites. A primeira é encontrada ao longo da Serra do Espinhaço, na região leste do Brasil, e as outras duas na região norte do Estado da Bahia, nas dunas continentais do Rio São Francisco, em margens opostas. Essas três espécies foram analisadas quanto a polimorfismos de tamanho de fragmentos de restrição (RFLP) do DNAmit, tendo sido caracterizados 53 sítios de restrição. Polimorfismos de sítio e de tamanho de alguns fragmentos específicos foram caracterizados, bem como casos de heteroplasmia envolvendo variações de tamanho. Em T. divaricatus, estas variações correspondem a 50-200 pb, provavelmente localizadas na região controle da molécula; em T. amathites, a variação é provavelmente devida a uma duplicação ou deleção de um segmento de 400 pb. A taxa de mutação envolvendo tamanho de fragmentos mostrou-se menor em T. amathites, quando comparada a T. divaricatus. Índices relativamente baixos de diversidade de nucleotídeos foram detectados em todas as populações analisadas, os menores sendo encontrados nas populações de T. nanuzae. T. divaricatus de Alagoado mostrou-se a população mais polimórfica, seguida da população de Ibiraba. É sugerido que estas duas populações possam estar recuperando a diversidade quanto ao DNAmit após possíveis reduções nos tamanhos populacionais. O maior grau de polimorfismo encontrado em T. divaricatus talvez reflita uma expansão populacional recente nesta espécie.
Details
- Language :
- English
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Genetics and Molecular Biology v.23 n.2 2000, Genetics and Molecular Biology, Sociedade Brasileira de Genética (SBG), instacron:SBG, Genetics and Molecular Biology, Volume: 23, Issue: 2, Pages: 351-356, Published: JUN 2000, Genetics and Molecular Biology, Vol 23, Iss 2, Pp 351-356 (2000)
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....f3441a74f5745ee983eef08f4a5a9767