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Predictive Modeling of Tacrolimus Dose Requirement Based on High-Throughput Genetic Screening

Authors :
Pierre Laurent-Puig
L. Toullec
Isabelle Etienne
Gabriel Choukroun
Cécile Vigneau
B. Hurault de Ligny
Mathias Büchler
Anne-Elisabeth Heng
Jean-François Subra
Antoine Thierry
E. Thervet
Anastasia Yartseva
Bruno Moulin
Cécilia Damon
C. Legendre
Dany Anglicheau
A. Monnot
Marie-Anne Loriot
Nicolas Pallet
P Beaune
Mathilde Bateson
Margaux Luck
Génétique, Reproduction et Développement (GReD )
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Service de néphrologie et immunologie clinique [CHRU Tours]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau-Université de Tours (UT)
Service de Néphrologie-Dialyse-Transplantation rénale [CHU Caen]
Université de Caen Normandie (UNICAEN)
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen
Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)
Mécanismes physiologiques et conséquences des calcifications cardiovasculaires: rôle des remodelages cardiovasculaires et osseux
Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Mécanismes physiopathologiques et conséquences des calcifications vasculaires - UR UPJV 7517 (MP3CV)
Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie
Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)
CHU Pontchaillou [Rennes]
Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset)
Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Service de Néphrologie - Hémodialyses [CHU Clermont-Ferrand]
Pôle RHEUNNIRS [CHU Clermont-Ferrand]
CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand]
CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand]
CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand
Service de Néphrologie [Angers]
Université d'Angers (UA)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers)
PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)
aucun
AGAETIS
Service de Transplantation Rénale
affiliation inconnue
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Service de néphrologie et immunologie clinique
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Université de Tours
Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA)
Domaines Océaniques (LDO)
Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Observatoire des Sciences de l'Univers-Institut d'écologie et environnement-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Génétique, Reproduction et Développement - Clermont Auvergne (GReD )
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST
Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Service de Néphrologie, Hôpital Gabriel Montpied, CHU de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand, France
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut d'écologie et environnement-Observatoire des Sciences de l'Univers-Université de Brest (UBO)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)
Université de Tours-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Source :
American Journal of Transplantation, American Journal of Transplantation, 2017, 17 (4), pp.1008-1019. ⟨10.1111/ajt.14040⟩, American Journal of Transplantation, Wiley, 2017, 17 (4), pp.1008-1019. ⟨10.1111/ajt.14040⟩
Publication Year :
2017
Publisher :
Elsevier BV, 2017.

Abstract

International audience; Any biochemical reaction underlying drug metabolism depends on individual gene-drug interactions and on groups of genes interacting together. Based on a high-throughput genetic approach, we sought to identify a set of covariant single-nucleotide polymorphisms predictive of interindividual tacrolimus (Tac) dose requirement variability. Tac blood concentrations (Tac C0 ) of 229 kidney transplant recipients were repeatedly monitored after transplantation over 3 mo. Given the high dimension of the genomic data in comparison to the low number of observations and the high multicolinearity among the variables (gene variants), we developed an original predictive approach that integrates an ensemble variable-selection strategy to reinforce the stability of the variable-selection process and multivariate modeling. Our predictive models explained up to 70% of total variability in Tac C0 per dose with a maximum of 44 gene variants (p-value

Details

ISSN :
16006135 and 16006143
Volume :
17
Database :
OpenAIRE
Journal :
American Journal of Transplantation
Accession number :
edsair.doi.dedup.....f1c1a89a259a49cc4b58a8e4b5d07603
Full Text :
https://doi.org/10.1111/ajt.14040