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Candidate chemosensory genes in the Stemborer Sesamia nonagrioides

Authors :
Paul-André Calatayud
Myriam Harry
Erwan Poivet
Nicolas Montagné
Fabrice Legeai
Aurore Gallot
Emmanuelle Jacquin-Joly
Nicolas Glaser
Physiologie de l'Insecte, Signalisation et Communication [Versailles] (PISC)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation [Gif-sur-Yvette] (LEGS)
Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR072-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale)
Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7)
Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Physiologie de l'Insecte : Signalisation et Communication (PISC)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-AgroParisTech
Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Evolution, adaptation et comportement
Département écologie évolutive [LBBE]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE)
Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)
Laboratoire Navier (navier umr 8205)
Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Évolution, génomes, comportement et écologie (EGCE)
Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-IRD-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7)
Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Inria Rennes – Bretagne Atlantique
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)
AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IRD-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)
Source :
International Journal of Biological Sciences, International Journal of Biological Sciences, Ivyspring International Publisher, 2013, 9 (5), pp.481-95. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, International Journal of Biological Sciences, 2013, 9 (5), pp.481-495. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, Int J Biol Sci, Int J Biol Sci, Ivyspring, 2013, 9 (5), pp.481-95. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, International Journal of Biological Sciences, Ivyspring International Publisher, 2013, 9 (5), pp.481-495. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, International Journal of Biological Sciences 5 (9), 481-495. (2013)
Publication Year :
2013
Publisher :
HAL CCSD, 2013.

Abstract

International audience; The stemborer Sesamia nonagrioides is an important pest of maize in the Mediterranean Basin. Like other moths, this noctuid uses its chemosensory system to efficiently interact with its environment. However, very little is known on the molecular mechanisms that underlie chemosensation in this species. Here, we used next-generation sequencing (454 and Illumina) on different tissues from adult and larvae, including chemosensory organs and female ovipositors, to describe the chemosensory transcriptome of S. nonagrioides and identify key molecular components of the pheromone production and detection systems. We identified a total of 68 candidate chemosen-sory genes in this species, including 31 candidate binding-proteins and 23 chemosensory receptors. In particular, we retrieved the three co-receptors Orco, IR25a and IR8a necessary for chemosensory receptor functioning. Focusing on the pheromonal communication system, we identified a new pheromone-binding protein in this species, four candidate pheromone receptors and 12 carboxylesterases as candidate acetate degrading enzymes. In addition, we identified enzymes putatively involved in S. nonagrioides pheromone biosynthesis, including a ∆11-desaturase and different acetyltransferases and reductases. RNAseq analyses and RT-PCR were combined to profile gene expression in different tissues. This study constitutes the first large scale description of chemosensory genes in S. nonagrioides.

Details

Language :
English
ISSN :
14492288
Database :
OpenAIRE
Journal :
International Journal of Biological Sciences, International Journal of Biological Sciences, Ivyspring International Publisher, 2013, 9 (5), pp.481-95. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, International Journal of Biological Sciences, 2013, 9 (5), pp.481-495. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, Int J Biol Sci, Int J Biol Sci, Ivyspring, 2013, 9 (5), pp.481-95. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, International Journal of Biological Sciences, Ivyspring International Publisher, 2013, 9 (5), pp.481-495. ⟨10.7150/ijbs.6109⟩, International Journal of Biological Sciences 5 (9), 481-495. (2013)
Accession number :
edsair.doi.dedup.....e7824362ae528e69c99953e4cae45a25
Full Text :
https://doi.org/10.7150/ijbs.6109⟩