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Desulfatiferula berrensis sp. nov., a n-alkene-degrading sulfate-reducing bacterium isolated from estuarine sediments

Authors :
Cristiana Cravo-Laureau
Vincent Grossi
Agnès Hirschler-Réa
Oulfat Amin-Ali
Robert Duran
Robert Matheron
Florence Hakil
Damien Mollex
Institut pluridisciplinaire de recherche sur l'environnement et les matériaux (IPREM)
Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut méditerranéen d'océanologie (MIO)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement (LGL-TPE)
École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE)
Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut Pluridisciplinaire de Recherche sur l'Environnement et les Matériaux (IPREM)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)
Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement [Lyon] (LGL-TPE)
École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)
Source :
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩
Publication Year :
2014
Publisher :
HAL CCSD, 2014.

Abstract

A novel sulfate-reducing bacterium designated strain BE2801T was isolated from oil-polluted estuarine sediments (Berre Lagoon, France). Cells were Gram-stain-negative, motile, slightly curved or vibrioid rods. Optimal growth of strain BE2801T occurred at 30–32 °C, 0.5–1.5% NaCl (w/v) and pH 7.2–7.4. Strain BE2801T grew with C4 to C20 fatty acids or C12 to C20 n-alkenes as electron donors. Acetate and carbon dioxide were the oxidation products. The major cellular fatty acids were C16 : 0, C16 : 1ω7c and C18 : 1ω7. The DNA G+C content was 50.2 mol%. 16S rRNA and dsrAB gene sequence analysis indicated that strain BE2801T was a member of the family Desulfobacteraceae within the class Deltaproteobacteria . DNA–DNA hybridization with the most closely related taxon demonstrated 14.8 % relatedness. Based on phenotypic and phylogenetic evidence, strain BE2801T ( = DSM 25524T = JCM 18157T) is proposed to be a representative of a novel species of the genus Desulfatiferula , for which the name Desulfatiferula berrensis sp. nov. is suggested.

Details

Language :
English
ISSN :
14665026 and 14665034
Database :
OpenAIRE
Journal :
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2014, 64 (Pt 2), pp.540-4. ⟨10.1099/ijs.0.057174-0⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....e76c79cf05060186674b95ace0817cd8