Validierungsstudie von 35 brustkrebsassoziierten SNPs in einem hospitalbezogenen Fall-Kontroll-Kollektiv

Fragestellung: Die genetische Disposition fur Brustkrebs ist zu einem erheblichen Teil durch das Zusammenspiel von Niedrigpenetranzvarianten, vor allem Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) bestimmt. Genomweite Assoziationsstudien der vergangenen Jahre haben zahlreiche SNPs identifiziert, die die Erkrankungswahrscheinlichkeit fur ein Mammakarzinom beeinflussen. Da solche mehrstufig gefilterten Studien durch einen „winner's curse“ verzerrt sein konnen, ist es wichtig, die Ergebnisse an unabhangigen Kollektiven und mit alternativer Methodik zu validieren. Methodik: Wir berichten hier uber die Analyse von 35 SNPs, die mittels genomweiter Assoziationsstudien des Breast Cancer Association Consortiums (BCAC) in den letzten drei Jahren mit Brustkrebs assoziiert wurden, in einer hospitalbezogenen Fall-Kontroll-Studie von 1000 Brustkrebspatientinnen und 1000 gesunden Blutspenderinnen an der Medizinischen Hochschule Hannover. Die Genotypisierung erfolgte mit allelspezifischen SNPtype Assays auf einer Fluidigm Biomark-Plattform. Ergebnis: Wir finden in der Gesamtanalyse eine nominal signifikante Assoziation mit Brustkrebs fur sechs der 35 Varianten (p < 0,05, 2df). In allen sechs Fallen stimmten die Richtung des Effekts und die Effektgrose mit den initialen Befunden des BCAC uberein. In stratifizierten Auswertungen, insbesondere bei Berucksichtigung des Ostrogenrezeptorstatus, konnten weitere Assoziationen bestatigt werden. Schlussfolgerung: Unsere Ergebnisse belegen die Vorhersagekraft multipler SNPs fur das Brustkrebsrisiko bereits ohne vorherige Selektion nach Alter oder Familienanamnese. Ein polygener Risikoscore konnte in Deutschland zukunftig zur Prazisierung der Erkrankungswahrscheinlichkeit fur Brustkrebs beitragen.