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Identification d’une signature moléculaire d’hypercortisolisme par analyse du methylome du sang total

Authors :
Martin Reincke
Guillaume Assié
Lucas Bouys
Stéphanie Allassonnière
Mario Neou
Anne Riester
Thomas Lartigue
Maria-Christina Zennaro
Jérôme Bertherat
Roberta Armignacco
Amandine Septier
Felix Beuschlein
Cassandra Gaspar
Leah T. Braun
Karine Perlemoine
Anne Jouinot
Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016))
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)
Algorithms, models and methods for images and signals of the human brain (ARAMIS)
Sorbonne Université (SU)-Inria de Paris
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre de Mathématiques Appliquées - Ecole Polytechnique (CMAP)
École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Plateforme Post-génomique de la Pitié-Salpêtrière (PASS-P3S)
Unité Mixte de Service Production et Analyse de données en Sciences de la vie et en Santé (PASS)
Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Ludwig Maximilian University [Munich] (LMU)
Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138))
École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP)
Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC (UMR_S 970/ U970))
Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)
[Institut Cochin] Département Endocrinologie, métabolisme, diabète (EMD) (EMD)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)
Universitätsspital Zürich (USZ)
ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019)
ANR-10-IAHU-0006,IHU-A-ICM,Institut de Neurosciences Translationnelles de Paris(2010)
European Project: 678304,H2020 ERC,ERC-2015-STG,LEASP(2016)
European Project: 666992,H2020 Pilier Societal Challenges,H2020-PHC-2015-two-stage,EuroPOND(2016)
European Project: 826421,TVB-Cloud (2018)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)
École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)
Lartigue, Thomas
PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE - - PRAIRIE2019 - ANR-19-P3IA-0001 - P3IA - VALID
Institut de Neurosciences Translationnelles de Paris - - IHU-A-ICM2010 - ANR-10-IAHU-0006 - IAHU - VALID
Learning spatiotemporal patterns in longitudinal image data sets of the aging brain - LEASP - - H2020 ERC2016-09-01 - 2021-08-31 - 678304 - VALID
Data-driven models for Progression Of Neurological Disease - EuroPOND - - H2020 Pilier Societal Challenges2016-01-01 - 2019-12-31 - 666992 - VALID
VirtualBrainCloud - TVB-Cloud - 2018-12-01 - 2022-11-30 - 826421 - VALID
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source :
Annales d'Endocrinologie, Annales d'Endocrinologie, Elsevier Masson, 2020, 81 (4), pp.180. ⟨10.1016/j.ando.2020.07.117⟩, Annales d'Endocrinologie, 2020, 81 (4), pp.180. ⟨10.1016/j.ando.2020.07.117⟩
Publication Year :
2020
Publisher :
HAL CCSD, 2020.

Abstract

Le diagnostic d’hypercortisolisme repose sur les dosages hormonaux. Or ces dosages ne refletent pas le risque individuel pour chaque complication de l’hypercortisolisme, car la susceptibilite interindividuelle varie, notamment dans les formes infra-cliniques. Objectif Identifier des biomarqueurs refletant l’impregnation individuelle en glucocorticoides a partir du methylome du sang total. Methodes Un total de 47 patients avec Cushing, separes en deux cohortes : entrainement (cas francs, n = 24) et validation (cas limites, n = 23). Pour chacun, prelevement d’une paire d’echantillons sanguins : avant et > 3 mois apres correction de l’hypercortisolisme. Generation du methylome du sang total par puce Illumina (850 K sondes). Resultats Dans la cohorte d’entrainement, la methylation de 28 % du genome varie selon le statut cortisolique. Le taux de polynucleaires neutrophiles infere a partir du methylome est fortement correle a la NFS (r = 0,81). Cette variation de NFS est, comme attendue, associee au statut cortisolique. Pour predire le statut Cushing/non Cushing a partir du methylome, une approche de regression penalisee basee uniquement sur la part non predite par la NFS identifie une combinaison de quelques endroits du genome (accuracies de 1 et 0,8 sur cohortes d’entrainement et de validation respectivement), qui ameliore la prediction sur la cohorte de validation par rapport a la NFS seule (accuracy = 0,65). Conclusion La methylation du genome est un biomarqueur de l’hypercortisolisme. Plusieurs questions sont en suspens, telles que la possibilite d’optimiser des techniques simples de mesures ciblees de methylation, la performance de ce biomarqueur dans les hypercortisolismes a minima, et les liens du profil de methylation avec les complications de l’hypercortisolisme.

Details

Language :
French
ISSN :
00034266 and 22133941
Database :
OpenAIRE
Journal :
Annales d'Endocrinologie, Annales d'Endocrinologie, Elsevier Masson, 2020, 81 (4), pp.180. ⟨10.1016/j.ando.2020.07.117⟩, Annales d'Endocrinologie, 2020, 81 (4), pp.180. ⟨10.1016/j.ando.2020.07.117⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....e0712b13f6803f46989e43e9483e11fa
Full Text :
https://doi.org/10.1016/j.ando.2020.07.117⟩