Back to Search Start Over

Diversity of foliar endophytic ascomycetes in the endemic Corsicanpine forests

Authors :
Sebastian A. Leidel
Annick Lesne
Pierre-Arthur Moreau
Laetitia Hugot
Franck Richard
Aarón Lecanda
Finn Kjellberg
Adrien Taudière
Jean-Michel Bellanger
Christopher Carcaillet
Karin Scharmann
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)
Centre de recherche en Biologie Cellulaire (CRBM)
Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre de Bio-Archéologie et d'Ecologie (CBAE)
Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés (LEHNA)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)
Conservatoire botanique national de Corse
Max Planck Research Group for RNA Biology
Max Planck Institute for Molecular Biomedicine
Max-Planck-Gesellschaft-Max-Planck-Gesellschaft
Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée (LPTMC)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)
Laboratoire de Botanique
Université de Lille-Faculté des sciences pharmaceutiques et biologiques
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)
Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Centre de recherche en Biologie cellulaire de Montpellier (CRBM)
Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)
Source :
Fungal Ecology, Fungal Ecology, Elsevier, 2018, 36, pp.128-140. ⟨10.1016/j.funeco.2018.07.008⟩, Fungal Ecology, 2018, 36, pp.128-140. ⟨10.1016/j.funeco.2018.07.008⟩
Publication Year :
2018
Publisher :
HAL CCSD, 2018.

Abstract

International audience; Plant leaves host species rich communities of foliar endophytic fungi (FEF). Compared to the other compartments of the plant microbiome, FEF diversity is poorly known. Here we document the communities of FEF associated with the endemic Corsican pine Pinus nigra subsp. laricio at three sites across its natural range and examine the effect of forest site, tree age and light exposure on FEF composition. Metabarcoding using next-generation sequencing provided 8,243,608 Ascomycota ITS2 sequences clustered into 642 FEF operational taxonomic units (OTUs). FEF communities did not differ in species richness across sites and tree cohorts, but differed in composition among forest patches and according to tree age. FEF community composition did not correlate with needle location (shade vs full light). Results are robust against the various options of the bioinformatic pipeline specifically developed. This study provides the first picture of FEF diversity in a Mediterranean island and underlines the complementarity of forest massifs for fungal conservation.

Details

Language :
English
ISSN :
17545048
Database :
OpenAIRE
Journal :
Fungal Ecology, Fungal Ecology, Elsevier, 2018, 36, pp.128-140. ⟨10.1016/j.funeco.2018.07.008⟩, Fungal Ecology, 2018, 36, pp.128-140. ⟨10.1016/j.funeco.2018.07.008⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....e039c9ffb6d56da967ddc4a1e504e64c