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An In-House Assay Is Superior to Sepsityper for Direct Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight (MALDI-TOF) Mass Spectrometry Identification of Yeast Species in Blood Cultures

Authors :
Hervé Pelloux
François Berger
Sébastien Bailly
Aurélie Hennebique
Danièle Maubon
Zine Eddine Kherraf
Isabelle Bonnet
Muriel Cornet
Marie Bidart
CHU Grenoble
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble
Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN )
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
COLETICA-ENGELHARD
Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] ( LAPM )
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Ecosystèmes montagnards ( UR EMGR )
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA )
Thérapeutique Recombinante Expérimentale ( TIMC-IMAG-THEREX )
Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] ( TIMC-IMAG )
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA )
Unité de Méthodologie et de Qualité de Vie en Cancérologie ( UMQVC )
Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC ( CEF2P / CARCINO )
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Pôle cancérologie (CHU Besançon)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Institut Régional Fédératif du Cancer ( IRFC )
Institut de Biologie et Pathologie
The University of Alabama at Birmingham [ Birmingham] ( UAB )
Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)
Thérapeutique Recombinante Expérimentale (TIMC-IMAG-TheREx)
Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG)
VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137))
Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble
Grenoble Institut des Neurosciences (GIN)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Ecosystèmes montagnards (UR EMGR)
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)
Unité de Méthodologie et de Qualité de Vie en Cancérologie (UMQVC)
Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) (CEF2P / CARCINO)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Franche-Comté (UFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Franche-Comté (UFC)-Pôle cancérologie (CHU Besançon)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Institut Régional Fédératif du Cancer (IRFC)
University of Alabama at Birmingham [ Birmingham] (UAB)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Université de Franche-Comté (UFC)
Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC)
Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Pôle cancérologie (CHRU Besançon)
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Institut Régional Fédératif du Cancer (IRFC)
HENNEBIQUE, Aurélie
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source :
Journal of Clinical Microbiology, Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1761-1764. 〈10.1128/JCM.03600-14〉, Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1761-1764. ⟨10.1128/JCM.03600-14⟩, Journal of Clinical Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1761-1764. ⟨10.1128/JCM.03600-14⟩
Publication Year :
2015
Publisher :
HAL CCSD, 2015.

Abstract

We developed an in-house assay for the direct identification, by matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry, of yeasts in blood culture. Sixty-one representative strains from 12 species were analyzed in spiked blood cultures. Our assay accurately identified 95 of 107 (88.8%) positive blood cultures and outperformed the commercial Sepsityper kit (81.7% identification).

Subjects

Subjects :
Microbiological Techniques
Microbiology (medical)
Chromatography
Chemistry
Matrix assisted laser desorption ionization time of flight
Mycology
Mass spectrometry
MALDI-TOF Mass Spectrometry
Sensitivity and Specificity
[SDV.MP.MYC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology
Yeast
Blood
Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization
Yeasts
Desorption
Humans
Fungemia
[SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology
ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
[ SDV.MP.MYC ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology

Details

Language :
English
ISSN :
00951137
Database :
OpenAIRE
Journal :
Journal of Clinical Microbiology, Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1761-1764. 〈10.1128/JCM.03600-14〉, Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1761-1764. ⟨10.1128/JCM.03600-14⟩, Journal of Clinical Microbiology, 2015, 53 (5), pp.1761-1764. ⟨10.1128/JCM.03600-14⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....cc522afc5db57ca3db4e98c34515c1bd
Full Text :
https://doi.org/10.1128/JCM.03600-14〉
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