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R2ucare: An R package to perform goodness-of-fit tests for capture-recapture models

Authors :
Olivier Gimenez
Rémi Choquet
Jean-Dominique Lebreton
Roger Pradel
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)
Centre d'études biologiques de Chizé (CEBC)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Source :
Methods in Ecology and Evolution, Methods in Ecology and Evolution, Wiley, 2018, Methods in Ecology and Evolution, Wiley, 2018, 9 (7), pp.1749-1754. ⟨10.1111/2041-210X.13014⟩
Publication Year :
2018
Publisher :
HAL CCSD, 2018.

Abstract

Assessing the quality of fit of a statistical model to data is a necessary step for conducting safe inference. We introduce R2ucare, an R package to perform goodness-of-fit tests for open single- and multi-state capture-recapture models. R2ucare also has various functions to manipulate capture-recapture data. We remind the basics and provide guidelines to navigate towards testing the fit of capture-recapture models. We demonstrate the functionality of R2ucare through its application to real data.

Details

Language :
English
ISSN :
2041210X
Database :
OpenAIRE
Journal :
Methods in Ecology and Evolution, Methods in Ecology and Evolution, Wiley, 2018, Methods in Ecology and Evolution, Wiley, 2018, 9 (7), pp.1749-1754. ⟨10.1111/2041-210X.13014⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....c659f6e347ca61d3f0b176d82d63d6bc