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Species Identification and In Vitro Antifungal Susceptibility of Aspergillus terreus Species Complex Clinical Isolates from a French Multicenter Study

Authors :
C. Bonnal
Sandrine Houzé
Sébastien Imbert
Christophe Hennequin
J. M. Costa
Isabelle Accoceberry
Juliette Guitard
Eric Dannaoui
Nathalie Bourgeois
Arnaud Fekkar
Françoise Botterel
Renaud Piarroux
Anne-Cécile Normand
Stéphane Ranque
Service de parasitologie - mycologie [CHU Pitié-Salpétrière]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]
Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)
Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
CHU Bordeaux [Bordeaux]
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
STFC Rutherford Appleton Laboratory (RAL)
Science and Technology Facilities Council (STFC)
Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat]
AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
Service de Parasitologie Mycologie [AP-HP Hôpital Bichat - Claude Bernard]
Mère et enfant face aux infections tropicales (MERIT - UMR_D 216)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)
Service de cancérologie et radiothérapie [Saint-Louis]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)
Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE)
Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)
Hôpital Européen Georges Pompidou
Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP)
Hôpital Henri Mondor
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)
Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)
Service de Parasitologie - Mycologie [CHU Pitié-Salpétrière]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA)
Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
Source :
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2018, 62 (5), ⟨10.1128/AAC.02315-17⟩, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2018, 62 (5), ⟨10.1128/AAC.02315-17⟩
Publication Year :
2018
Publisher :
HAL CCSD, 2018.

Abstract

Aspergillus section Terrei is a species complex currently comprised of 14 cryptic species whose prevalence in clinical samples as well as antifungal susceptibility are poorly known. The aims of this study were to investigate A. Terrei clinical isolates at the species level and to perform antifungal susceptibility analyses by reference and commercial methods. Eighty-two clinical A. Terrei isolates were collected from 8 French university hospitals. Molecular identification was performed by sequencing parts of beta-tubulin and calmodulin genes. MICs or minimum effective concentrations (MECs) were determined for 8 antifungal drugs using both EUCAST broth microdilution (BMD) methods and concentration gradient strips (CGS). Among the 79 A. Terrei isolates, A. terreus stricto sensu ( n = 61), A. citrinoterreus ( n = 13), A. hortai ( n = 3), and A. alabamensis ( n = 2) were identified. All strains had MICs of ≥1 mg/liter for amphotericin B, except for two isolates (both A. hortai ) that had MICs of 0.25 mg/liter. Four A. terreus isolates were resistant to at least one azole drug, including one with pan-azole resistance, yet no mutation in the CYP51A gene was found. All strains had low MECs for the three echinocandins. The essential agreements (EAs) between BMD and CGS were >90%, except for those of amphotericin B (79.7%) and itraconazole (73.4%). Isolates belonging to the A . section Terrei identified in clinical samples show wider species diversity beyond the known A. terreus sensu stricto . Azole resistance inside the section Terrei is uncommon and is not related to CYP51A mutations here. Finally, CGS is an interesting alternative for routine antifungal susceptibility testing.

Details

Language :
English
ISSN :
00664804 and 10986596
Database :
OpenAIRE
Journal :
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology, 2018, 62 (5), ⟨10.1128/AAC.02315-17⟩, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2018, 62 (5), ⟨10.1128/AAC.02315-17⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....af6375575d31130d2c087f1d27f85cab