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Understanding the molecular basis of the high oxygen affinity variant human hemoglobin Coimbra
- Source :
- Archives of Biochemistry and Biophysics. 637:73-78
- Publication Year :
- 2018
- Publisher :
- Elsevier BV, 2018.
-
Abstract
- Human hemoglobin (Hb) Coimbra (βAsp99Glu) is one of the seven βAsp99 Hb variants described to date. All βAsp99 substitutions result in increased affinity for O2 and decreased heme-heme cooperativity and their carriers are clinically characterized by erythrocytocis, caused by tissue hypoxia. Since βAsp99 plays an important role in the allosteric α1β2 interface and the mutation in Hb Coimbra only represents the insertion of a CH2 group in this interface, the present study of Hb Coimbra is important for a better understanding of the global impact of small modifications in this allosteric interface. We carried out functional, kinetic and dynamic characterization of this hemoglobin, focusing on the interpretation of these results in the context of a growth of the position 99 side chain length in the α1β2 interface. Oxygen affinity was evaluated by measuring p50 values in distinct pHs (Bohr effect), and the heme-heme cooperativity was analyzed by determining the Hill coefficient (n), in addition to the effect of the allosteric effectors inositol hexaphosphate (IHP) and 2,3-bisphosphoglyceric acid (2,3-BPG). Computer simulations revealed a stabilization of the R state in the Coimbra variant with respect to the wild type, and consistently, the T-to-R quaternary transition was observed on the nanosecond time scale of classical molecular dynamics simulations. Fil: Jorge, S. E.. Universidade Estadual de Campinas; Brasil Fil: Bringas, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina Fil: Petruk, Ariel Alcides. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina Fil: Arrar, Mehrnoosh. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina Fil: Marti, Marcelo Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina Fil: Skaf, M. S.. Universidade Estadual de Campinas; Brasil Fil: Costa, F. F.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina Fil: Capece, Luciana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina Fil: Sonati, M. F.. Universidade Estadual de Campinas; Brasil Fil: Estrin, Dario Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química, Física de los Materiales, Medioambiente y Energía; Argentina
- Subjects :
- Models, Molecular
0301 basic medicine
P50
Phytic Acid
Hemoglobins, Abnormal
Allosteric regulation
Biophysics
Context (language use)
Bohr effect
Cooperativity
Heme
In Vitro Techniques
Molecular Dynamics Simulation
medicine.disease_cause
Biochemistry
Ciencias Biológicas
03 medical and health sciences
Allosteric Regulation
POLYCYTHEMIA
medicine
Humans
Protein Interaction Domains and Motifs
Protein Structure, Quaternary
Molecular Biology
2,3-Diphosphoglycerate
HEMOGLOBIN VARIANT
Mutation
HB COIMBRA
030102 biochemistry & molecular biology
Chemistry
Wild type
Bioquímica y Biología Molecular
Oxygen
Kinetics
030104 developmental biology
ALLOSTERY
OXYGEN AFFINITY
Hemoglobin
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
Subjects
Details
- ISSN :
- 00039861
- Volume :
- 637
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Archives of Biochemistry and Biophysics
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....ace4fa9bada0f1f6f985efd8a88fe87d