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Corrigendum: A unique peptide deformylase platform to rationally design and challenge novel active compounds

Authors :
Thierry Meinnel
Karim Hamiche
Rodolphe Alves de Sousa
Carmela Giglione
Laure Maigre
Alexis Denis
Sonia Fieulaine
Jean-Michel Bolla
Isabelle Artaud
Mickael Alimi
Abbass Taleb
Jean-Marie Pagès
Interactions et mécanismes d’assemblage des protéines et des peptides (IMAPP)
Département Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale (B3S)
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire de Chimie et de Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques (LCBPT - UMR 8601)
Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Membranes et cibles thérapeutiques (MCT)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)-Aix Marseille Université (AMU)
Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Antenne Marseille] (IRBA)
GlaxoSmithKline
Glaxo Smith Kline
Maturation des proteines, destinée cellulaire et thérapeutique (PROMTI)
Département Biologie des Génomes (DBG)
Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)
SERRE, Marie-Claude
Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA)
Source :
Scientific Reports, Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2017, 7, pp.39365. ⟨10.1038/srep39365⟩, Scientific Reports, 2017, 7, pp.39365. ⟨10.1038/srep39365⟩
Publication Year :
2017
Publisher :
Nature Publishing Group, 2017.

Abstract

Peptide deformylase (PDF) is considered an excellent target to develop antibiotics. We have performed an extensive characterization of a new PDF from the pathogen Streptococcus agalactiae, showing properties similar to other known PDFs. S. agalactiae PDF could be used as PDF prototype as it allowed to get complete sets of 3-dimensional, biophysical and kinetic data with virtually any inhibitor compound. Structure-activity relationship analysis with this single reference system allowed us to reveal distinct binding modes for different PDF inhibitors and the key role of a hydrogen bond in potentiating the interaction between ligand and target. We propose this protein as an irreplaceable tool, allowing easy and relevant fine comparisons between series, to design, challenge and validate novel series of inhibitors. As proof-of-concept, we report here the design and synthesis of effective specific bacterial PDF inhibitors of an oxadiazole series with potent antimicrobial activity against a multidrug resistant clinical isolate.

Details

Language :
English
ISSN :
20452322
Volume :
7
Database :
OpenAIRE
Journal :
Scientific Reports
Accession number :
edsair.doi.dedup.....a57d06c00f096e2f7db1d8e48b7938f4
Full Text :
https://doi.org/10.1038/srep39365⟩