Back to Search Start Over

Evaluation of HIV transmission clusters among natives and foreigners living in Italy

Authors :
Fabeni L.
Santoro M. M.
Lorenzini P.
Rusconi S.
Gianotti N.
Costantini A.
Sarmati L.
Antinori A.
Ceccherini-Silberstein F.
d'Arminio Monforte A.
Saracino A.
Girardi E.
Castagna A.
Castelli F.
Cauda R.
Di Perri G.
Galli M.
Iardino R.
Ippolito G.
Lazzarin A.
Marchetti G. C.
Rezza G.
von Schloesser F.
Viale P.
Cozzi-Lepri A.
Gori A.
Lo Caputo S.
Maggiolo F.
Mussini C.
Puoti M.
Perno C. F.
Bai F.
Bandera A.
Bonora S.
Borderi M.
Calcagno A.
Capobianchi M. R.
Cicalini S.
Cingolani A.
Cinque P.
Di Biagio A.
Gagliardini R.
Guaraldi G.
Lapadula G.
Lichtner M.
Lai A.
Madeddu G.
Merlini E.
Nozza S.
Piconi S.
Pinnetti C.
Quiros Roldan E.
Rossotti R.
Spagnuolo V.
Svicher V.
Taramasso L.
Fanti I.
Galli L.
Rodano A.
Macchia M.
Tavelli A.
Bove A.
Camposeragna A.
Errico M.
Manfredini M.
Perziano A.
Calvino V.
Carrara S.
Di Caro A.
Graziano S.
Petroni F.
Prota G.
Truffa S.
Giacometti A.
Barocci V.
Angarano G.
Monno L.
Milano E.
Suardi C.
Donati V.
Verucchi G.
Castelnuovo F.
Minardi C.
Menzaghi B.
Abeli C.
Chessa L.
Pes F.
Cacopardo B.
Celesia B.
Vecchiet J.
Falasca K.
Pan A.
Lorenzotti S.
Sighinolfi L.
Segala D.
Blanc P.
Vichi F.
Cassola G.
Bassetti M.
Alessandrini A.
Bobbio N.
Mazzarello G.
Fondaco L.
Bonfanti P.
Molteni C.
Chiodera A.
Milini P.
Nunnari G.
Pellicano G.
Rizzardini G.
Cannizzo E. S.
Moioli M. C.
Piolini R.
Bernacchia D.
Poli A.
Tincati C.
Puzzolante C.
Migliorino C.
Sangiovanni V.
Borgia G.
Esposito V.
Di Flumeri G.
Gentile I.
Rizzo V.
Cattelan A. M.
Marinello S.
Cascio A.
Trizzino M.
Francisci D.
Schiaroli E.
Parruti G.
Sozio F.
Lazzaretti C.
Corsini R.
Cristaudo A.
Vullo V.
Acinapura R.
Lamonica S.
Capozzi M.
Mondi A.
Rivano Capparuccia M.
Iaiani G.
Latini A.
Onnelli G.
Plazzi M. M.
de Girolamo G.
Vergori A.
Cecchetto M.
Viviani F.
de Vito A.
Rossetti B.
Montagnani F.
Franco A.
Fontana Del Vecchio R.
Di Giuli C.
Caramello P.
Orofino G. C.
Sciandra M.
Londero A.
Manfrin V.
Battagin G.
Starnini G.
Ialungo A.
Fabeni L.
Santoro M.M.
Lorenzini P.
Rusconi S.
Gianotti N.
Costantini A.
Sarmati L.
Antinori A.
Ceccherini-Silberstein F.
d'Arminio Monforte A.
Saracino A.
Girardi E.
Castagna A.
Castelli F.
Cauda R.
Di Perri G.
Galli M.
Iardino R.
Ippolito G.
Lazzarin A.
Marchetti G.C.
Rezza G.
von Schloesser F.
Viale P.
Cozzi-Lepri A.
Gori A.
Lo Caputo S.
Maggiolo F.
Mussini C.
Puoti M.
Perno C.F.
Bai F.
Bandera A.
Bonora S.
Borderi M.
Calcagno A.
Capobianchi M.R.
Cicalini S.
Cingolani A.
Cinque P.
Di Biagio A.
Gagliardini R.
Guaraldi G.
Lapadula G.
Lichtner M.
Lai A.
Madeddu G.
Merlini E.
Nozza S.
Piconi S.
Pinnetti C.
Quiros Roldan E.
Rossotti R.
Spagnuolo V.
Svicher V.
Taramasso L.
Fanti I.
Galli L.
Rodano A.
Macchia M.
Tavelli A.
Bove A.
Camposeragna A.
Errico M.
Manfredini M.
Perziano A.
Calvino V.
Carrara S.
Di Caro A.
Graziano S.
Petroni F.
Prota G.
Truffa S.
Giacometti A.
Barocci V.
Angarano G.
Monno L.
Milano E.
Suardi C.
Donati V.
Verucchi G.
Castelnuovo F.
Minardi C.
Menzaghi B.
Abeli C.
Chessa L.
Pes F.
Cacopardo B.
Celesia B.
Vecchiet J.
Falasca K.
Pan A.
Lorenzotti S.
Sighinolfi L.
Segala D.
Blanc P.
Vichi F.
Cassola G.
Bassetti M.
Alessandrini A.
Bobbio N.
Mazzarello G.
Fondaco L.
Bonfanti P.
Molteni C.
Chiodera A.
Milini P.
Nunnari G.
Pellicano G.
Rizzardini G.
Cannizzo E.S.
Moioli M.C.
Piolini R.
Bernacchia D.
Poli A.
Tincati C.
Puzzolante C.
Migliorino C.
Sangiovanni V.
Borgia G.
Esposito V.
Di Flumeri G.
Gentile I.
Rizzo V.
Cattelan A.M.
Marinello S.
Cascio A.
Trizzino M.
Francisci D.
Schiaroli E.
Parruti G.
Sozio F.
Lazzaretti C.
Corsini R.
Cristaudo A.
Vullo V.
Acinapura R.
Lamonica S.
Capozzi M.
Mondi A.
Rivano Capparuccia M.
Iaiani G.
Latini A.
Onnelli G.
Plazzi M.M.
de Girolamo G.
Vergori A.
Cecchetto M.
Viviani F.
de Vito A.
Rossetti B.
Montagnani F.
Franco A.
Fontana Del Vecchio R.
Di Giuli C.
Caramello P.
Orofino G.C.
Sciandra M.
Londero A.
Manfrin V.
Battagin G.
Starnini G.
Ialungo A.
Fabeni, L.
Santoro, M. M.
Lorenzini, P.
Rusconi, S.
Gianotti, N.
Costantini, A.
Sarmati, L.
Antinori, A.
Ceccherini-Silberstein, F.
d'Arminio Monforte, A.
Saracino, A.
Girardi, E.
Castagna, A.
Castelli, F.
Cauda, R.
Di Perri, G.
Galli, M.
Iardino, R.
Ippolito, G.
Lazzarin, A.
Marchetti, G. C.
Rezza, G.
von Schloesser, F.
Viale, P.
Cozzi-Lepri, A.
Gori, A.
Lo Caputo, S.
Maggiolo, F.
Mussini, C.
Puoti, M.
Perno, C. F.
Bai, F.
Bandera, A.
Bonora, S.
Borderi, M.
Calcagno, A.
Capobianchi, M. R.
Cicalini, S.
Cingolani, A.
Cinque, P.
Di Biagio, A.
Gagliardini, R.
Guaraldi, G.
Lapadula, G.
Lichtner, M.
Lai, A.
Madeddu, G.
Merlini, E.
Nozza, S.
Piconi, S.
Pinnetti, C.
Quiros Roldan, E.
Rossotti, R.
Spagnuolo, V.
Svicher, V.
Taramasso, L.
Fanti, I.
Galli, L.
Rodano, A.
Macchia, M.
Tavelli, A.
Bove, A.
Camposeragna, A.
Errico, M.
Manfredini, M.
Perziano, A.
Calvino, V.
Carrara, S.
Di Caro, A.
Graziano, S.
Petroni, F.
Prota, G.
Truffa, S.
Giacometti, A.
Barocci, V.
Angarano, G.
Monno, L.
Milano, E.
Suardi, C.
Donati, V.
Verucchi, G.
Castelnuovo, F.
Minardi, C.
Menzaghi, B.
Abeli, C.
Chessa, L.
Pes, F.
Cacopardo, B.
Celesia, B.
Vecchiet, J.
Falasca, K.
Pan, A.
Lorenzotti, S.
Sighinolfi, L.
Segala, D.
Blanc, P.
Vichi, F.
Cassola, G.
Bassetti, M.
Alessandrini, A.
Bobbio, N.
Mazzarello, G.
Fondaco, L.
Bonfanti, P.
Molteni, C.
Chiodera, A.
Milini, P.
Nunnari, G.
Pellicano, G.
Rizzardini, G.
Cannizzo, E. S.
Moioli, M. C.
Piolini, R.
Bernacchia, D.
Poli, A.
Tincati, C.
Puzzolante, C.
Migliorino, C.
Sangiovanni, V.
Borgia, G.
Esposito, V.
Di Flumeri, G.
Gentile, I.
Rizzo, V.
Cattelan, A. M.
Marinello, S.
Cascio, A.
Trizzino, M.
Francisci, D.
Schiaroli, E.
Parruti, G.
Sozio, F.
Lazzaretti, C.
Corsini, R.
Cristaudo, A.
Vullo, V.
Acinapura, R.
Lamonica, S.
Capozzi, M.
Mondi, A.
Rivano Capparuccia, M.
Iaiani, G.
Latini, A.
Onnelli, G.
Plazzi, M. M.
de Girolamo, G.
Vergori, A.
Cecchetto, M.
Viviani, F.
de Vito, A.
Rossetti, B.
Montagnani, F.
Franco, A.
Fontana Del Vecchio, R.
Di Giuli, C.
Caramello, P.
Orofino, G. C.
Sciandra, M.
Londero, A.
Manfrin, V.
Battagin, G.
Starnini, G.
Ialungo, A.
Source :
Viruses, Vol 12, Iss 791, p 791 (2020), Viruses, Volume 12, Issue 8
Publication Year :
2020
Publisher :
MDPI AG, 2020.

Abstract

We aimed at evaluating the characteristics of HIV-1 molecular transmission clusters (MTCs) among natives and migrants living in Italy, diagnosed between 1998 and 2018. Phylogenetic analyses were performed on HIV-1 polymerase (pol) sequences to characterise subtypes and identify MTCs, divided into small (SMTCs, 2&ndash<br />3 sequences), medium (MMTCs, 4&ndash<br />9 sequences) and large (LMTCs, &ge<br />10 sequences). Among 3499 drug-na&iuml<br />ve individuals enrolled in the Italian Cohort Naive Antiretroviral (ICONA) cohort (2804 natives<br />695 migrants), 726 (20.8%<br />644 natives, 82 migrants) were involved in 228 MTCs (6 LMTCs, 36 MMTCs, 186 SMTCs). Migrants contributed 14.4% to SMTCs, 7.6% to MMTCs and 7.1% to LMTCs, respectively. HIV-1 non-B subtypes were found in 51 MTCs<br />noteworthy was that non-B infections involved in MTCs were more commonly found in natives (n = 47) than in migrants (n = 4). Factors such as Italian origin, being men who have sex with men (MSM), younger age, more recent diagnosis and a higher CD4 count were significantly associated with MTCs. Our findings show that HIV-1 clustering transmission among newly diagnosed individuals living in Italy is prevalently driven by natives, mainly MSM, with a more recent diagnosis and frequently infected with HIV-1 non-B subtypes. These results can contribute to monitoring of the HIV epidemic and guiding the public health response to prevent new HIV infections.

Subjects

Subjects :
0301 basic medicine
Male
lcsh:QR1-502
Subtype
HIV Infections
migrants
Bioinformatics
Cluster detection
Drug resistance testing
Human immunodeficiency virus (HIV)
Migrants
Molecular epidemiology
Phylogenetic analysis
Risk factors
Subtypes
Transmission networks and clusters
Adult
Cohort Studies
Female
Genotype
HIV-1
Humans
Italy
Middle Aged
Sexual and Gender Minorities
pol Gene Products, Human Immunodeficiency Virus
Emigrants and Immigrants
Phylogeny
lcsh:Microbiology
Men who have sex with men
0302 clinical medicine
human immunodeficiency virus (HIV)
molecular epidemiology
phylogenetic analysis
cluster detection
transmission networks and clusters
subtypes
drug resistance testing
risk factors
bioinformatics
Medicine
030212 general & internal medicine
pol Gene Products
Hiv transmission
Transmission (medicine)
virus diseases
Infectious Diseases
Cohort
Human Immunodeficiency Virus
Cohort study
medicine.medical_specialty
Article
NO
03 medical and health sciences
Phylogenetic analysi
Virology
Bioinformatic
business.industry
Public health
Migrant
Settore MED/17
030104 developmental biology
Risk factor
business
Demography

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
Viruses, Vol 12, Iss 791, p 791 (2020), Viruses, Volume 12, Issue 8
Accession number :
edsair.doi.dedup.....a4ee3c7bfbd0a0553bacff6ef4ec6a65

Tools

Authors Abstract Subjects Details