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Detection of QTL associated with rust resistance using IBD-based methodologies in exogamic Eucalyptus spp. populations
- Source :
- Crop Breeding and Applied Biotechnology, Volume: 10, Issue: 4, Pages: 321-328, Published: DEC 2010, Crop Breeding and Applied Biotechnology v.10 n.4 2010, Crop Breeding and Applied Biotechnology, Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, instacron:CBAB, LOCUS Repositório Institucional da UFV, Universidade Federal de Viçosa (UFV), instacron:UFV
- Publication Year :
- 2010
- Publisher :
- FapUNIFESP (SciELO), 2010.
-
Abstract
- No Brasil, a ferrugem causada por Puccinia psidii Winter destaca-se como a mais importante doença do eucalipto. O uso de genótipos resistentes é o principal método de controle, o que torna a detecção de marcadores ligados a resistência à ferrugem essencial para a seleção de genótipos resistentes. Neste estudo, uma progênie F1 composta por 131 plantas derivadas de um cruzamento interespecífico de Eucalyptus.Um mapa integrado foi construído para o grupo de ligação três com base em marcadores microssatélites. Para detecção de QTL foram utilizadas duas metodologias baseadas em alelos idênticos por descendência (IBD): marca simples de Haseman and Elston e mapeamento por intervalo de Fulker and Cardon. Ambas as metodologias evidenciaram associação mais significativa para o marcador Embra 125. O QTL que explicou 42 % da variação fenotípica foi mapeado a 0,02 cM desse marcador pela metodologia de intervalo de Fulker and Cardon. O marcador Embra125 têm potencial utilização em seleção assistida, com conseqüente aumento na eficiência durante a seleção de genótipos resistentes. In Brazil the rust caused by Puccinia psidii Winter stands out as the most important disease of eucalyptus. The use of resistant genotypes is the main control method, which makes the detection of markers linked to rust resistance essential to the selection of resistant genotypes. In this study, an F1 progeny of 131 plants from interspecific crossings of Eucalyptus was used to identify markers linked to resistance genes for this pathogen. An integrated map was constructed for linkage group three based on microsatellite markers. For QTL mapping two methodologies based on alleles identical-by-descent (IBD) were used: single marker analysis of Haseman and Elston and the interval mapping procedure of Fulker and Cardon. Both methods showed significant association for the Embra 125 marker.The QTL that explained 42 % of the phenotypic variation was mapped to 0.02 cM of this marker by the Fulker and Cardon. Marker Embra 125 has potential use in assisted selection, thus increasing the efficiency of the selection of resistant genotypes.
- Subjects :
- Eucalyptus grandis
QTL mapping
molecular marker
mapeamento de QTL
Genetics
biology
Puccinia psidii
Eucalyptus urophylla
Quantitative trait locus
Plant disease resistance
biology.organism_classification
Rust
chemistry.chemical_compound
Gene mapping
chemistry
Genetic marker
Molecular marker
marcador molecular
Puccinia psidi
General Earth and Planetary Sciences
Microsatellite
General Environmental Science
Subjects
Details
- ISSN :
- 19847033
- Volume :
- 10
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Crop Breeding and Applied Biotechnology
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....a2302cc722979539a84b235c420663b4
- Full Text :
- https://doi.org/10.1590/s1984-70332010000400006