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Characterisation of hydrocarbon degradation, biosurfactant production, and biofilm formation in Serratia sp. Tan611: a new strain isolated from industrially contaminated environment in Algeria

Authors :
Emmanuelle Leize-Wagner
Philippe N. Bertin
Lisa Gil
Frédéric Plewniak
Farid Bensalah
Annela Semai
Céline Lopez-Roques
Céline Vandecasteele
Armelle Charrié-Duhaut
Amalia Sayeh
Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM)
Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université d'Oran 1 Ahmed Ben Bella [Oran]
Chimie de la matière complexe (CMC)
Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique ( GeT-PlaGe)
Plateforme Génome & Transcriptome (GET)
Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
CNRS national program EC2CO-MicrobiEn: DMO/DMA project
ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010)
Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Source :
Antonie van Leeuwenhoek, Antonie van Leeuwenhoek, Springer Verlag, 2021, 114 (4), pp.411-424. ⟨10.1007/s10482-021-01527-5⟩
Publication Year :
2021
Publisher :
Springer Science and Business Media LLC, 2021.

Abstract

A novel bacterial strain was isolated from industrially contaminated waste water. In the presence of crude oil, this strain was shown to reduce the rate of total petroleum hydrocarbons (TPH) up to 97.10% in 24 h. This bacterium was subsequently identified by 16S rRNA gene sequence analysis and affiliated to the Serratia genus by the RDP classifier. Its genome was sequenced and annotated, and genes coding for catechol 1,2 dioxygenase and naphthalene 1,2-dioxygenase system involved in aromatic hydrocarbon catabolism, and LadA-type monooxygenases involved in alkane degradation, were identified. Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) analysis of crude oil after biological treatment showed that Serratia sp. Tan611 strain was able to degrade n-alkanes (from C-13 to C-25). This bacterium was also shown to produce a biosurfactant, the emulsification index (E24) reaching 43.47% and 65.22%, against vegetable and crude oil, respectively. Finally, the formation of a biofilm was increased in the presence of crude oil. These observations make Serratia sp. Tan611 a good candidate for hydrocarbon bioremediation.

Details

ISSN :
15729699 and 00036072
Volume :
114
Database :
OpenAIRE
Journal :
Antonie van Leeuwenhoek
Accession number :
edsair.doi.dedup.....94511d7f3e2629aa39d24dbb31c899cb