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PESO: a modelling framework to help improve management strategies for epidemics - application to sharka

Authors :
Loup Rimbaud
Samuel Soubeyrand
Gaël Thébaud
Pascal Hendrikx
Coralie Picard
Emmanuel Jacquot
Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI)
Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Agriculture and Food
Universidad de La Rioja (UR)
Direction des Laboratoires, Unité de Coordination et d'Appui à la Surveillance
Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)
Biostatistique et Processus Spatiaux (BIOSP)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Biostatistique et Processus Spatiaux (BioSP)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Source :
EPPO Bulletin, EPPO Bulletin, Wiley, 2017, 47 (2), pp.231-236. ⟨10.1111/epp.12375⟩
Publication Year :
2017
Publisher :
HAL CCSD, 2017.

Abstract

BGPI: équipe 6Paper based on work presented at the Joint EFSA-EPPO Workshop: Modelling in Plant Health – how can models support risk assessment of plant pests and decision-making? 12th–14th December 2016, Parma, Italy; International audience; The optimization of management strategies for plant diseases is a difficult task because of the complexity and variability of epidemic dynamics. Thanks to their ability to numerically simulate many scenarios, models can be used to estimate epidemiological parameters, assess the effectiveness of different management strategies and optimize them. This article presents the PESO (parameter estimation–simulation–optimization) modelling framework to help improve plant disease management strategies. This framework is based on (i) the characterization of the epidemic dynamics to estimate key epidemiological parameters, (ii) the use of spatially explicit models to simulate epidemic dynamics and disease management, and (iii) the use of numerical optimization methods to identify better management strategies. This approach is generic and can be applied to many diseases. The work presented here focuses on sharka (caused by Plum pox virus), which has a worldwide impact on the Prunus industry, and is associated with huge disease management costs in many countries, especially in France.

Details

Language :
English
ISSN :
02508052 and 13652338
Database :
OpenAIRE
Journal :
EPPO Bulletin, EPPO Bulletin, Wiley, 2017, 47 (2), pp.231-236. ⟨10.1111/epp.12375⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....726edc679460848e13c862a8ec34d975
Full Text :
https://doi.org/10.1111/epp.12375⟩