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Análise de sequência do rDNA da região espaçadora do transcrito interno 2 (ITS2) para identificar espécies de Trichogramma e avaliar a diversidade genética
- Source :
- Brazilian Journal of Biology, Vol 81, Iss 4, Pp 928-933 (2020), Brazilian Journal of Biology v.81 n.4 2021, Brazilian Journal of Biology, Instituto Internacional de Ecologia (IIE), instacron:IIE, Brazilian Journal of Biology, Volume: 81, Issue: 4, Pages: 928-933, Published: 23 OCT 2020, Brazilian Journal of Biology, Issue: ahead, Published: 12 OCT 2020, Repositório Institucional da EMBRAPA (Repository Open Access to Scientific Information from EMBRAPA-Alice), Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), instacron:EMBRAPA
- Publication Year :
- 2021
- Publisher :
- FapUNIFESP (SciELO), 2021.
-
Abstract
- Species of Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammtidae) are frequently used as biological control agents against Lepidoptera, but practical application of these egg endoparasitoids are complicated because of their complex taxonomy. This study aimed to compare sequences of internal transcribed spacer regions of ribosomal DNA (ITS2-rDNA) of Trichogramma accessions with those deposited in GenBank in order to access the reliability of the ITS2 as a barcode for discriminating species and evaluating the genetic diversity. ITS2-rDNA sequences obtained from seventeen specimens of Trichogramma confirmed previous identifications based on morphological characteristics. Multiple sequence alignment revealed the existence of highly conserved regions in ITS2 sequences while the neighbour-joining dendrogram indicated that the specimens formed three clusters comprising T. manicobai and T. marandobai (group I), T. galloi (group II) and T. pretiosum (group III). The ITS2 marker was shown to be a powerful DNA barcode for discriminating Trichogramma species and could be used to complement the morphological approach. Resumo Espécies de Trichogramma Westwood, 1833 (Hymenoptera: Trichogrammatidae) são freqüentemente usadas como agentes de controle biológico contra Lepidoptera, esses endoparasitóides de ovos apresentam taxonomia complexa, o que dificulta sua aplicação prática. Este estudo teve como objetivo comparar seqüências de regiões espaçadoras internas transcritas de DNA ribossômico (ITS2-rDNA) de acessos de Trichogramma com aquelas depositadas no GenBank, a fim de avaliar a confiabilidade do ITS2 barcode para discriminar espécies e avaliar a diversidade genética. As seqüências de ITS2-rDNA obtidas de dezessete espécimes de Trichogramma confirmaram identidades anteriores com base em características morfológicas. O alinhamento de múltiplas sequências revelou a existência de regiões altamente conservadas nas sequências ITS2, enquanto o dendrograma indicou que os espécimes formavam três grupos compreendendo T. manicobai e T. marandobai (grupo I), T. galloi (grupo II) e T. pretiosum (grupo III). O marcador ITS2 mostrou ser um poderoso DNA barcode para discriminar espécies de Trichogramma podendo ser usado como complemento da abordagem morfológica.
- Subjects :
- 0106 biological sciences
QH301-705.5
Sequence analysis
similaridade genética
Science
010607 zoology
DNA, Ribosomal
010603 evolutionary biology
01 natural sciences
DNA barcoding
polimorfismo de nucleotídeos
DNA, Ribosomal Spacer
parasitic diseases
Animals
Trichogramma spp
Biology (General)
Internal transcribed spacer
Ribosomal DNA
Phylogeny
Genetic diversity
Multiple sequence alignment
Trichogramma
biology
egg parasitoids
Botany
Genetic Variation
Reproducibility of Results
Sequence Analysis, DNA
biology.organism_classification
Hymenoptera
Lepidoptera
parasitóides de ovos
QL1-991
Evolutionary biology
QK1-989
GenBank
genetic similarity
nucleotide polymorphisms
General Agricultural and Biological Sciences
Zoology
Subjects
Details
- ISSN :
- 16784375 and 15196984
- Volume :
- 81
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Brazilian Journal of Biology
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....5215d03cea38c5433f247dbd43d09bc7