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Highly Repeatable Dissolution Dynamic Nuclear Polarization for Heteronuclear NMR Metabolomics

Authors :
Geoffrey Bodenhausen
Daniel J. Jacob
Jonas Milani
Sami Jannin
Annick Moing
Basile Vuichoud
Mickaël Maucourt
Jean-Nicolas Dumez
Aurélien Bornet
Catherine Deborde
Xiao Ji
Patrick Giraudeau
Institut des sciences et d'ingénierie chimiques (ISIC)
Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)
Biologie du fruit et pathologie (BFP)
Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1
1074 Institut de Biologie Végétale Moléculaire : actions communes
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Institut de Biologie Végétale Moléculaire : actions communes (IBVM)
UMR1332 Fruit Biology and Pathology
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Platetorme Métabolome Bordeaux
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Département de Chimie - ENS Paris
École normale supérieure - Paris (ENS Paris)
Bruker Biospin AG
Chimie Et Interdisciplinarité : Synthèse, Analyse, Modélisation (CEISAM)
Université de Nantes - Faculté des Sciences et des Techniques
Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
CORSAIRE metabolomics platform (Biogenouest network)
Swiss National Science Foundation (SNSF)
Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL)
Swiss Commission for Technology and Innovation (CTI)
CNRS
European Research Council (ERC) [339754]
Bruker BioSpin
MetaboHUB [ANR-11-INBS-010]
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST)
Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)
Plateforme Bordeaux Metabolome
Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Bordeaux
MetaboHUB-MetaboHUB
Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source :
Analytical Chemistry, Analytical Chemistry, American Chemical Society, 2016, 88 (12), pp.6179-6183. ⟨10.1021/acs.analchem.6b01094⟩, Analytical Chemistry, 2016, 88 (12), pp.6179-6183. ⟨10.1021/acs.analchem.6b01094⟩
Publication Year :
2016
Publisher :
HAL CCSD, 2016.

Abstract

International audience; At natural C-13 abundance, metabolomics based on heteronuclear NMR is limited by sensitivity. We have recently demonstrated how hyperpolarization by dissolution dynamic nuclear polarization (D-DNP) assisted by cross-polarization (CP) provides a reliable way of enhancing the sensitivity of heteronudear NMR in dilute mixtures of metabolites. In this Technical Note, we evaluate the precision of this experimental approach, a critical point for applications to metabolomics. The higher the repeatability, the greater the likelihood that one can detect small biologically relevant differences between samples. The average repeatability of our state-of-the-art D-DNP NMR equipment for samples of metabolomic relevance (20 mg dry weight tomato extracts) is 3.6% for signals above the limit of quantification (LOQ) and 6.4% when all the signals above the limit of detection (LOD) are taken into account. This first report on the repeatability of D-DNP highlights the compatibility of the technique with the requirements of metabolomics and confirms its potential as an analytical tool for such applications.

Details

Language :
English
ISSN :
00032700 and 15206882
Database :
OpenAIRE
Journal :
Analytical Chemistry, Analytical Chemistry, American Chemical Society, 2016, 88 (12), pp.6179-6183. ⟨10.1021/acs.analchem.6b01094⟩, Analytical Chemistry, 2016, 88 (12), pp.6179-6183. ⟨10.1021/acs.analchem.6b01094⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....427a9fd13e79fd365ccc62cccaadd57e
Full Text :
https://doi.org/10.1021/acs.analchem.6b01094⟩