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Cytogenetical anchoring of sheep linkage map and syntenic groups using a sheep BAC library
- Source :
- Genetics, Selection, Evolution : GSE, Genetics Selection Evolution, Genetics Selection Evolution, BioMed Central, 2000, 32 (4), pp.441-457. ⟨10.1051/gse:2000130⟩, Genetics Selection Evolution, Vol 32, Iss 4, Pp 441-457 (2000)
- Publication Year :
- 2000
- Publisher :
- BioMed Central, 2000.
-
Abstract
- International audience; In order to simultaneously integrate linkage and syntenic groups to the ovine chromosomal map, a sheep bacterial artificial chromosome (BAC) library was screened with previously assigned microsatellites using a sheep-hamster hybrid panel and genetic linkage. Thirty-three BACs were obtained, fluorescently labelled and hybridised on sheep-goat hybrid metaphases ($2{\rm n} = 57$). This study allowed us, (i), to anchor all linkage groups on sheep chromosomes, (ii), to give information on the probable position of the centromere on the linkage map for the centromeric chromosomes, (iii), to contradict the previous orientation of the ovine X linkage group by the mapping of BMS1008 on OARXq38. Concerning our somatic cell hybrid panel, this study resulted in the assignment of all the previously unassigned groups to ovine chromosomes and a complete characterisation of the hybrid panel. In addition, since hybridisations were performed on a sheep-goat hybrid, new marker/anchoring points were added to the caprine cytogenetic map.; Ancrage cytogénétique de la carte de liaison et des groupes de synténie par utilisation d'une banque de BAC ovine. Afin d'intégrer, la carte génétique et les groupes de synténies à la carte chromosomique ovine, nous avons criblé, à l'aide de microsatellites, une banque ovine de chromosomes artificiels de bactéries (BAC). Les microsatellites utilisés font partie de la carte de liaison ovine et ont été localisés précédemment dans notre panel d'hybrides somatiques hamster-mouton. Nous avons isolé 33 clones BAC, marqués en fluorescence et hybridés sur métaphase d'un hybride chèvre-mouton ($2{\rm n} = 57$). Les résultats de cette étude ont apporté plusieurs informations. Au niveau de la carte génétique, ces localisations ont permis l'ancrage des groupes de liaison sur les chromosomes ovins et de donner la position la plus probable du centromère sur les groupes de liaison correspondant aux chromosomes métacentriques. De plus, pour le chromosome X, la localisation du microsatellite BMS1008 a permis de corriger l'orientation du groupe de liaison. Au niveau de notre panel d'hybrides somatiques hamster-mouton, ces résultats ont permis d'assigner cytogénétiquement tous les groupes de synténies à un chromosome ovin, aboutissant à une caractérisation approfondie du panel. Enfin, en utilisant des métaphases d'hybride chèvre-mouton pour les hybridations in situ, nous avons pu ajouter de nouveaux marqueurs et points d'ancrages sur la carte chromosomique caprine.
- Subjects :
- 0106 biological sciences
medicine.medical_specialty
microsatellite
sheep
lcsh:QH426-470
mouton
Biology
01 natural sciences
03 medical and health sciences
Gene mapping
FISH
Genetic linkage
Centromere
medicine
Genetics
Genetics(clinical)
mapping
Ecology, Evolution, Behavior and Systematics
BAC library
030304 developmental biology
Synteny
lcsh:SF1-1100
Linkage (software)
0303 health sciences
Bacterial artificial chromosome
Research
Cytogenetics
General Medicine
lcsh:Genetics
banque BAC
[SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics
BAC library---cartographie
Microsatellite
Animal Science and Zoology
lcsh:Animal culture
010606 plant biology & botany
Subjects
Details
- Language :
- English
- ISSN :
- 12979686 and 0999193X
- Volume :
- 32
- Issue :
- 4
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Genetics, Selection, Evolution : GSE
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....4203c9f221b4cf419edb3af42248a3be
- Full Text :
- https://doi.org/10.1051/gse:2000130⟩