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Selection of Pseudomonas aeruginosa reference genes for RT-qPCR analysis from sputum of cystic fibrosis patients

Authors :
Patricia Costaglioli
Michael Fayon
Philippe Domblides
Sébastien Vilain
Laurence Derlich
Christophe Barthe
Bertrand Garbay
Naik Christoflour
Marc Crouzet
Stéphanie Bui
Biotechnologie des protéines recombinantes à visée santé
Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux
CHU Bordeaux, Dept Pediat CRCM, INSERM Ctr Invest Clin CIC5
Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
CHU Bordeaux, Ctr Rech Mucoviscidose CRCM Adulte
CHU Bordeaux [Bordeaux]
Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques (LCPO)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Team 3 LCPO : Polymer Self-Assembly & Life Sciences
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Source :
Molecular and Cellular Probes, Molecular and Cellular Probes, Elsevier, 2014, 28 (1), pp.10-12. ⟨10.1016/j.mcp.2013.09.003⟩
Publication Year :
2013

Abstract

International audience; The prerequisite to monitor gene expression is the selection of reference genes for normalization of RT-qPCR results. Using 13 sputum samples collected from 9 CF patients, we demonstrated that PA2875 and PA3340 are better reference genes than the previously used clpX and oprL genes. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Subjects

Subjects :
Cystic Fibrosis
Biology
medicine.disease_cause
Real-Time Polymerase Chain Reaction
Cystic fibrosis
Microbiology
03 medical and health sciences
Reference genes
Gene expression
medicine
Humans
Molecular Biology
Gene
Selection (genetic algorithm)
030304 developmental biology
0303 health sciences
030306 microbiology
Pseudomonas aeruginosa
Gene Expression Profiling
Sputum
Cell Biology
medicine.disease
3. Good health
[CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers
Genes, Bacterial
medicine.symptom

Details

ISSN :
10961194 and 08908508
Volume :
28
Issue :
1
Database :
OpenAIRE
Journal :
Molecular and cellular probes
Accession number :
edsair.doi.dedup.....3e01b92505035449ac24aadfe70248f1

Tools

Authors Abstract Subjects Details