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Identification of 28 novel mutations in the Bardet-Biedl syndrome genes: the burden of private mutations in an extensively heterogeneous disease

Authors :
Serge Vicaire
Dominique Bonneau
Pierre Bitoun
Nicholas Katsanis
Sophie Hellé
Alice Goldenberg
Valérie Drouin-Garraud
Marie-Claire Vincent
Jean Marc Danse
Vincent Marion
Sabine Sigaudy
Joelle Roume
M. Hamdani
Sylvie Odent
Christine Francannet
Erica E. Davis
Alain Verloes
V. Bennouna-Greene
Jean Muller
Josseline Kaplan
Hélène Dollfus
Virginie Laurier
Jean-Louis Mandel
André Mégarbané
Carmen C. Leitch
Jane Green
Mireille Cossée
Corinne Stoetzel
Nicole Philip
Olivier Poch
Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)
Laboratoire de diagnostic génétique
CHU Strasbourg
Laboratoire de Génétique Médicale (LGM)
Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine
Johns Hopkins University (JHU)
Unité de Génétique Médicale
Université Saint-Joseph de Beyrouth (USJ)
Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781)
Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Service de génétique [Rouen]
CHU Rouen
Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN)
Normandie Université (NU)
Hôpital 20 Août 1953
Service de Génétique et de Diagnostic Prénatal
Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2
Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)
Service de génétique médicale
CHI Poissy-Saint-Germain
Service de Pédiatrie [Jean Verdier]
Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM]
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)
Service de Génétique Clinique
Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-hôpital Sud
Department of Genetics
Memorial University of Newfoundland [St. John's]
Center for Human Disease Modeling
Duke University [Durham]
Service de génétique [Angers]
Université d'Angers (UA)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers)
PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)
Unité fonctionnelle de génétique clinique
Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Robert Debré-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC)
Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Chaire Génétique Humaine
Collège de France (CdF (institution))
Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Service de génétique clinique [Rennes]
Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud
Memorial University of Newfoundland = Université Memorial de Terre-Neuve [St. John's, Canada] (MUN)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Collège de France - Chaire Génétique Humaine
De Villemeur, Hervé
Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire ( IGBMC )
Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Laboratoire de Génétique Médicale
Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg]-AVENIR-Inserm
Johns Hopkins University ( JHU )
Université Saint-Joseph de Beyrouth ( USJ )
Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 )
Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN )
Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU )
Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA )
Université Paris 13 ( UP13 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier
Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Université de Rennes 1 ( UR1 )
Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Sud
Duke university [Durham]
Université d'Angers ( UA ) -CHU Angers
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 )
Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire ( IGBMC )
Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Source :
Human Genetics, Human Genetics, Springer Verlag, 2010, 127 (5), pp.583-93. ⟨10.1007/s00439-010-0804-9⟩, Human Genetics, 2010, 127 (5), pp.583-93. ⟨10.1007/s00439-010-0804-9⟩, Human Genetics, Springer Verlag, 2010, 127 (5), pp.583-93. 〈10.1007/s00439-010-0804-9〉
Publication Year :
2010
Publisher :
HAL CCSD, 2010.

Abstract

International audience; Bardet-Biedl syndrome (BBS), an emblematic disease in the rapidly evolving field of ciliopathies, is characterized by pleiotropic clinical features and extensive genetic heterogeneity. To date, 14 BBS genes have been identified, 3 of which have been found mutated only in a single BBS family each (BBS11/TRIM32, BBS13/MKS1 and BBS14/MKS4/NPHP6). Previous reports of systematic mutation detection in large cohorts of BBS families (n > 90) have dealt only with a single gene, or at most small subsets of the known BBS genes. Here we report extensive analysis of a cohort of 174 BBS families for 12/14 genes, leading to the identification of 28 novel mutations. Two pathogenic mutations in a single gene have been found in 117 families, and a single heterozygous mutation in 17 families (of which 8 involve the BBS1 recurrent mutation, M390R). We confirm that BBS1 and BBS10 are the most frequently mutated genes, followed by BBS12. No mutations have been found in BBS11/TRIM32, the identification of which as a BBS gene only relies on a single missense mutation in a single consanguineous family. While a third variant allele has been observed in a few families, they are in most cases missenses of uncertain pathogenicity, contrasting with the type of mutations observed as two alleles in a single gene. We discuss the various strategies for diagnostic mutation detection, including homozygosity mapping and targeted arrays for the detection of previously reported mutations.

Details

Language :
English
ISSN :
03406717 and 14321203
Database :
OpenAIRE
Journal :
Human Genetics, Human Genetics, Springer Verlag, 2010, 127 (5), pp.583-93. ⟨10.1007/s00439-010-0804-9⟩, Human Genetics, 2010, 127 (5), pp.583-93. ⟨10.1007/s00439-010-0804-9⟩, Human Genetics, Springer Verlag, 2010, 127 (5), pp.583-93. 〈10.1007/s00439-010-0804-9〉
Accession number :
edsair.doi.dedup.....371e52fd6b2c5514fd0c45f77e0b1a49
Full Text :
https://doi.org/10.1007/s00439-010-0804-9⟩