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AraDiv: a dataset of functional traits and leaf hyperspectral reflectance of Arabidopsis thaliana

Authors :
Maria Stefania Przybylska
Cyrille Violle
Denis Vile
J. F. Scheepens
Benoit Lacombe
Xavier Le Roux
Lisa Perrier
Lou Sales-Mabily
Mariette Laumond
Mariona Vinyeta
Pierre Moulin
Gregory Beurier
Lauriane Rouan
Denis Cornet
François Vasseur
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE)
Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-École Pratique des Hautes Études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM)
Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE)
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro
Goethe-University Frankfurt am Main
Institut des Sciences des Plantes de Montpellier (IPSIM)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier
Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM)
Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier
Agence National de la Recherche (ANR
European Research Council (ERC) Starting Grant Project 'Ecophysiological and biophysical constraints on domestication in crop plants' (Grant ERC-StG-2014- 639706-CONSTRAINTS
European Research Council (ERC) Starting Grant Project 'PHENOVIGOUR' (Grant ERC-StG-2020-949843)
ANR-17-CE02-0018,AraBreed,Exploration des réponses évolutives des plantes à des changements environnementaux à la lumière des théories écologiques : un test expérimental chez l'espèce modèle Arabidopsis thaliana(2017)
European Project: 639706,H2020,ERC-2014-STG,CONSTRAINTS(2015)
Source :
Scientific Data, Scientific Data, 2023, 10, ⟨10.1038/s41597-023-02189-w⟩
Publication Year :
2023
Publisher :
HAL CCSD, 2023.

Abstract

Data from functional trait databases have been increasingly used to address questions related to plant diversity and trait-environment relationships. However, such databases provide intraspecific data that combine individual records obtained from distinct populations at different sites and, hence, environmental conditions. This prevents distinguishing sources of variation (e.g., genetic-based variation vs. phenotypic plasticity), a necessary condition to test for adaptive processes and other determinants of plant phenotypic diversity. Consequently, individual traits measured under common growing conditions and encompassing within-species variation across the occupied geographic range have the potential to leverage trait databases with valuable data for functional and evolutionary ecology. Here, we recorded 16 functional traits and leaf hyperspectral reflectance (NIRS) data for 721 widely distributed Arabidopsis thaliana natural accessions grown in a common garden experiment. These data records, together with meteorological variables obtained during the experiment, were assembled to create the AraDiv dataset. AraDiv is a comprehensive dataset of A. thaliana’s intraspecific variability that can be explored to address questions at the interface of genetics and ecology.

Details

Language :
English
ISSN :
20524463
Database :
OpenAIRE
Journal :
Scientific Data, Scientific Data, 2023, 10, ⟨10.1038/s41597-023-02189-w⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....30d7d7b31cc4673bbe295ceb1de72dfa