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First report of chayote yellow mosaic virus in Côte d’Ivoire: a divergent strain infecting bitter melon

Authors :
Anthelme-Jocelin N’cho
Koutoua Séka
Murielle Hoareau
Pierre Lefeuvre
Marie-France Kouadio
Lassina Fondio
Daouda Koné
Germain Ochou
Hortense Diallo
Thibaud Martin
Jean-Michel Lett
Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Université Nangui Abrogoua (UNA)
Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
Université Félix Houphouët-Boigny (UFHB)
Centre National de la Recherche Agronomique - CNRA (IVORY COAST)
Fonctionnement agroécologique et performances des systèmes de cultures horticoles (UPR HORTSYS)
Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST)
This study was funded by the European Union (ERDF, contract GURDT I2016-1731–0006632), the Conseil Régional de la Réunion and CIRAD, and was conducted at the Plant Protection Platform (3P, IBISA). Jocelin N’cho is funded by a PhD fellowship from the French Ministry of Foreign Affairs via the C2D fund ‘Contrat de Désendettement et de Développement, Volet N°2 de recherche du projet AMRUGE-CI 2 (Appui à la Modernisation et à la Réforme des Universités et Grandes Ecoles de Côte d’Ivoire)’ through the project entitled ‘Adaptation et Développement de la culture protégée dans les conditions climatiques de la Côte d’Ivoire (HortiNet-CI)’.
European Project: ED431G2019/06,ERDF
Source :
Australasian Plant Disease Notes, Australasian Plant Disease Notes, 2022, 17 (1), pp.23. ⟨10.1007/s13314-022-00469-9⟩
Publication Year :
2022
Publisher :
HAL CCSD, 2022.

Abstract

International audience; In this report, we present the first description of nine complete genome sequences of a new strain of chayote yellow mosaic virus (ChaYMV, genus Begomovirus, family Geminiviridae), provisionally named Cote d'Ivoire (ChaYMV-CI), isolated from bitter melon (Momordica charantia) leaf samples showing yellow mosaic symptoms collected in the region of Abidjan in Cote d'Ivoire in 2013 and 2019. The nucleotide sequences of ChaYMV-CI DNA-A-like genome share the highest nucleotide sequence identities (91.8-92.5%) with those of ChaYMV isolates from Benin and Cameroon. Phylogenetic analysis confirmed the segregation of ChaYMV isolates into two distinct clades and their affiliation to Old World monopartite begomoviruses. The discovery of a new strain of ChaYMV in West Africa, at the limit of the taxonomic demarcation threshold for begomoviruses (91%), call for further investigations into the molecular diversity, geographical distribution and host range of ChaYMV in Western Africa.

Details

Language :
English
ISSN :
1833928X
Database :
OpenAIRE
Journal :
Australasian Plant Disease Notes, Australasian Plant Disease Notes, 2022, 17 (1), pp.23. ⟨10.1007/s13314-022-00469-9⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....29c65cc190bb0ee97f9b17477523469a