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Unsuspected Diversity of Arsenite-Oxidizing Bacteria Revealed by a Widespread Distribution of the aoxB Gene in Prokaryotes

Authors :
Christophe Pagnout
Céline Brochier-Armanet
David Halter
Audrey Cordi
Elham Abbaszadeh-fard
Didier Montaut
Florence Arsène-Ploetze
Pascale Bauda
Philippe N. Bertin
Fabienne Séby
Audrey Heinrich-Salmeron
Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM)
Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire des Interactions Ecotoxicologie, Biodiversité, Ecosystèmes (LIEBE)
Université Paul Verlaine - Metz (UPVM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive (BPGE)
Département PEGASE [LBBE] (PEGASE)
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE)
Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE)
Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Ultra Traces Analyses Aquitaine (UT2A)
Ultra Traces Analyses Aquitaine
Source :
Applied and Environmental Microbiology, Applied and Environmental Microbiology, 2011, 77, pp.4685-92. ⟨10.1128/AEM.02884-10⟩, Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2011, 77, pp.4685-92. ⟨10.1128/AEM.02884-10⟩
Publication Year :
2011
Publisher :
HAL CCSD, 2011.

Abstract

In this study, new strains were isolated from an environment with elevated arsenic levels, Sainte-Marie-aux-Mines (France), and the diversity of aoxB genes encoding the arsenite oxidase large subunit was investigated. The distribution of bacterial aoxB genes is wider than what was previously thought. AoxB subfamilies characterized by specific signatures were identified. An exhaustive analysis of AoxB sequences from this study and from public databases shows that horizontal gene transfer has likely played a role in the spreading of aoxB in prokaryotic communities.

Details

Language :
English
ISSN :
00992240 and 10985336
Database :
OpenAIRE
Journal :
Applied and Environmental Microbiology, Applied and Environmental Microbiology, 2011, 77, pp.4685-92. ⟨10.1128/AEM.02884-10⟩, Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2011, 77, pp.4685-92. ⟨10.1128/AEM.02884-10⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....27124bf537cb135eb1ba1817b4bafc59