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Author Correction: A framework to identify contributing genes in patients with Phelan-McDermid syndrome

Authors :
Stephan Kemeny
Sandrine Passemard
Sandra Chantot-Bastaraud
Chloé Quélin
Laurence Perrin
Julien Buratti
Patrick Edery
Céline Dupont
Chantal Missirian
Philippe Vago
Alexandra Afenjar
Marie-Laure Vuillaume
Yline Capri
Klaus Dieterich
Laila El Khattabi
Charles Coutton
Françoise Devillard
Annick Toutain
Alain Verloes
Nicole Philip
Hubert Journel
Véronique Satre
Marie Ducloy
Delphine Héron
Richard Delorme
Cédric Le Caignec
Anne-Claude Tabet
Damien Sanlaville
Isabelle Marey
Laurence Faivre
Christèle Dubourg
Anne-Laure Mosca-Boidron
Laetitia Gouas
Abdelamdjid Benmansour
Jean Chiesa
Séverine Drunat
Cyril Mignot
Aurélia Jacquette
Boris Keren
Claire S. Leblond
Claire Beneteau
Brigitte Benzacken
Vincent Gatinois
Olivier Pichon
Damien Haye
Roberto Toro
Sandra Whalen
Dominique Martin
Thomas Rolland
Thomas Bourgeron
Albert David
Alexandre Mathieu
Mélanie Fradin
Frédérique Amsellem
Bertrand Isidor
James Lespinasse
Caroline Rooryck
Jacques Puechberty
Eva Pipiras
Lucile Pinson
Didier Lacombe
Jonathan M. Levy
Génétique humaine et fonctions cognitives - Human Genetics and Cognitive Functions (GHFC (UMR_3571 / U-Pasteur_1))
Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)
Département de génétique [Robert Debré]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Service Histologie-embryologie-cytogénétique
Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP]
CHU Trousseau [APHP]
Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes]
Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)
Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016))
Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
CHU Estaing [Clermont-Ferrand]
CHU Clermont-Ferrand
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC)
Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)
Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG)
Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle [Hospices civils de Lyon]
Hospices Civils de Lyon (HCL)
CHU de Lyon
Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)
Grenoble Institut des Neurosciences (GIN)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Service de génétique médicale
Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin
Service de génétique médicale [Montpellier]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve
Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] (CHU Nîmes)
Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes)
Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM)
Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre Hospitalier de Chambéry (C.H.de Chambéry)
Service de génétique clinique [Rennes]
Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud
Génétique médicale [Centre Hospitalier de Vannes]
Centre hospitalier Bretagne Atlantique (Morbihan) (CHBA)
Service de génétique [Tours]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau
Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans)
AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris]
Service Psychiatrie de l'Enfant et de l'Adolescent
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré
UF de Cytogénétique
Institut Pasteur [Paris]
Université de Bordeaux (UB)
École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)
Unité de Mathématique, Informatique et Génome (MIG)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne (LICB)
Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)
Service de génétique clinique [Debré]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré
Service de Génétique
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris]
Neuroprotection du Cerveau en Développement / Promoting Research Oriented Towards Early Cns Therapies (PROTECT)
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (CRICM)
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Service de génétique [CHU Pitié-Salpêtrière]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]
Service de génétique, cytogénétique, embryologie [Pitié-Salpétrière]
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]
Institut de Myologie
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Jean Verdier [Bondy]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)
Service de Génétique et d'Embryologie Médicale
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Trousseau [APHP]
Gatonero SA
Hôtel-Dieu de Nantes
Physiopathologie et thérapie du muscle strié
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR14-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Génétique Médicale
CHU Clermont-Ferrand-Hôpital d'Estaing
Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Laboratoire de génétique chromosomique [Hôpital de la Timone - APHM]
Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)
Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)
Centre de référence des anomalies du développement [Lyon]
UF de Biochimie et Génétique Moléculaire (BGM)
CHU Grenoble
Dynamique Cellulaire et Tissulaire- Interdisciplinarité, Modèles & Microscopies (TIMC-IMAG-DyCTiM)
Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG)
Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
IMAXIO
Maladies rares, génétique et métabolisme / Rare Diseases, Genetics and Metabolism
École de sage femme - Groupe hospitalier Pellegrin - CHU de Bordeaux-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB)
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)
Institut de génétique humaine (IGH)
Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes]
Département de Génétique Chromosomique
Bâtiment Hôtel Dieu - Centre Hospitalier de Chambéry
Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR)
Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Sud
CLAD Ouest
Centre Hospitalier Universitaire [Rennes]
Centre Hospitalier Bretagne Atlantique [Vannes]
Génétique Humaine et Fonctions Cognitives
Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Service de Génétique Cytogénétique et Embryologie [CHU Pitié-Salpêtrière]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Service de génétique, cytogénétique, embryologie [CHU Pitié-Salpétrière]
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)
Rolland, Thomas
Source :
NPJ Genomic Medicine, npj Genomic Medicine, npj Genomic Medicine, 2019, 4 (1), pp.16. ⟨10.1038/s41525-019-0090-y⟩, npj Genomic Medicine, Springer Nature, 2019, 4 (1), pp.16. ⟨10.1038/s41525-019-0090-y⟩, npj Genomic Medicine, Vol 4, Iss 1, Pp 1-1 (2019)
Publication Year :
2019
Publisher :
Springer Science and Business Media LLC, 2019.

Abstract

Phelan-McDermid syndrome (PMS) is characterized by a variety of clinical symptoms with heterogeneous degrees of severity, including intellectual disability (ID), absent or delayed speech, and autism spectrum disorders (ASD). It results from a deletion of the distal part of chromosome 22q13 that in most cases includes the SHANK3 gene. SHANK3 is considered a major gene for PMS, but the factors that modulate the severity of the syndrome remain largely unknown. In this study, we investigated 85 patients with different 22q13 rearrangements (78 deletions and 7 duplications). We first explored the clinical features associated with PMS, and provide evidence for frequent corpus callosum abnormalities in 28% of 35 patients with brain imaging data. We then mapped several candidate genomic regions at the 22q13 region associated with high risk of clinical features, and suggest a second locus at 22q13 associated with absence of speech. Finally, in some cases, we identified additional clinically relevant copy-number variants (CNVs) at loci associated with ASD, such as 16p11.2 and 15q11q13, which could modulate the severity of the syndrome. We also report an inherited SHANK3 deletion transmitted to five affected daughters by a mother without ID nor ASD, suggesting that some individuals could compensate for such mutations. In summary, we shed light on the genotype-phenotype relationship of patients with PMS, a step towards the identification of compensatory mechanisms for a better prognosis and possibly treatments of patients with neurodevelopmental disorders.<br />The underlying genetics of Phelan-McDermid syndrome Multiple chromosomal changes may impact the severity of symptoms in people with Phelan-McDermid syndrome (PMS). Thomas Bourgeron of the Institut Pasteur and colleagues in France conducted genomic analyses and explored the clinical features of 85 people with PMS, a condition caused by a deletion in the long arm of chromosome 22. It is often associated with severe symptoms such as intellectual disability, autism, and seizures. The chromosomal changes in 65% of those studied were not inherited. MRI brain scans showed visible abnormalities in 23 of 35 patients imaged. The size of the chromosomal deletion varied. Patients with small deletions were more likely to have autistic symptoms while those with large deletions were more likely to be unable to talk. The team also identified genes in chromosome 22 and in other regions of the genome that could modify the severity of PMS symptoms.

Details

ISSN :
20567944
Volume :
4
Database :
OpenAIRE
Journal :
npj Genomic Medicine
Accession number :
edsair.doi.dedup.....1dd312a9b62d083a113f0569d2dea422