Back to Search Start Over

Molecular and chemical characterization of a Sphagnum palustre clone: Key steps towards a standardized and sustainable moss bag technique

Authors :
Fiore Capozzi
Aridane G. González
Roberto Bargagli
Ralf Reski
Oleg S. Pokrovsky
D. Crespo Pardo
Simonetta Giordano
A. Di Palma
Paola Adamo
Anna K. Beike
Valeria Spagnuolo
Mauro Tretiach
D. Cafasso
Z. Varela
Jesús R. Aboal
DI PALMA, Anna
CRESPO PARDO, David
Spagnuolo, Valeria
Adamo, Paola
Bargagli, R.
Cafasso, Donata
Capozzi, Fiore
Aboal, J. R.
González, A. G.
Pokrovsky, O.
Beike, A. K.
Reski, R.
Tretiach, M.
Varela, Z.
Giordano, Simonetta
Università di Bologna [Bologna] (UNIBO)
Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire des Mécanismes et Transfert en Géologie (LMTG)
Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie (IEMN) - UMR 8520 (IEMN)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF)-Ecole Centrale de Lille-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF)-Institut supérieur de l'électronique et du numérique (ISEN)
Di Palma, A.
Crespo Pardo, D.
Spagnuolo, V
Adamo, P.
Cafasso, D.
Tretiach, Mauro
Giordano, S.
University of Naples Federico II
Department of Physical Sciences, Earth and Environment [Siena] (DSFTA)
Università degli Studi di Siena = University of Siena (UNISI)
Dipartimento di Scienze della Vita [Trieste]
Università degli studi di Trieste
Universidade de Santiago de Compostela [Spain] (USC )
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Géosciences Environnement Toulouse (GET)
Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Tomsk State University [Tomsk]
Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS)
Stuttgart State Museum of Natural History
Fakultät für Biologie = Faculty of Biology [Freiburg]
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Centre for Biological Signaling Studies [Freiburg] (BIOSS)
University of Freiburg [Freiburg]
European Project: 282952,EC:FP7:ENV,FP7-ENV-2011-ECO-INNOVATION-TwoStage,MOSSCLONE(2012)
University of Naples Federico II = Università degli studi di Napoli Federico II
Università degli studi di Trieste = University of Trieste
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Source :
Ecological Indicators, Ecological Indicators, Elsevier, 2016, 71, pp.388--397. ⟨10.1016/j.ecolind.2016.06.044⟩, Ecological Indicators, Elsevier, 2016, 71, pp.388-397. ⟨10.1016/j.ecolind.2016.06.044⟩, Ecological Indicators, 2016, 71, pp.388-397. ⟨10.1016/j.ecolind.2016.06.044⟩
Publication Year :
2016

Abstract

00002 ăWOS:000388157900039; International audience; This work aimed to define the molecular and chemical signature of a S. palustre clone developed in the framework of the EU-FP7 Mossclone project to improve the standardization and reliability of the moss bag technique. The molecular characterization was performed by a set of DNA molecular markers (RAPD, ISJ, PCR-RFLP, sequencing and microsatellites) to tag the clone produced within the project. Molecular characterization also provided new DNA markers that can be applied in systematic analyses of Sphagnum, and gave new insights to implement well established techniques. The elemental composition of the clone was measured by ICP-MS analysis of 54 major and trace elements, with and without commonly applied pre-exposure treatments (oven devitalization and EDTA washing). Concentrations of almost all analyzed elements were significantly lower (from 10 to 100 times) in the clone than in conspecific field moss, apart from some elements (K, Mo, P and Na) deriving from the culture medium or EDTA treatment. Oven devitalization and EDTA washing did not significantly affect the clone composition. A comparison between the elemental composition of the clone with that of naturally growing Sphagnum species proved the particularly low elemental content of the clone. Therefore, in view of a rigorously standardized moss-bag protocol for the monitoring of persistent atmospheric pollutants, the use of the S. palustre clone, a biomaterial with very low and constant element composition, and homogenous morphological characteristics is strongly recommended. (C) 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Details

Language :
English
ISSN :
1470160X
Database :
OpenAIRE
Journal :
Ecological Indicators, Ecological Indicators, Elsevier, 2016, 71, pp.388--397. ⟨10.1016/j.ecolind.2016.06.044⟩, Ecological Indicators, Elsevier, 2016, 71, pp.388-397. ⟨10.1016/j.ecolind.2016.06.044⟩, Ecological Indicators, 2016, 71, pp.388-397. ⟨10.1016/j.ecolind.2016.06.044⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....1a4e8994cd5ec045e760b12e0f71980d