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Evolutionary Genomics of Genes Involved in Olfactory Behavior in the Drosophila melanogaster Species Group
- Source :
- Evolutionary Bioinformatics, r-CIPF: Repositorio Institucional Producción Científica del Centro de Investigación Principe Felipe (CIPF), Centro de Investigación Principe Felipe (CIPF), Evolutionary Bioinformatics, Vol 2012, Iss 8, Pp 89-104 (2012), Evol. Bioinformatics 2011;2011(7):89-104, Biblioteca Digital (UBA-FCEN), Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, instacron:UBA-FCEN, r-CIPF. Repositorio Institucional Producción Científica del Centro de Investigación Principe Felipe (CIPF), instname, CONICET Digital (CONICET), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, instacron:CONICET
- Publication Year :
- 2012
- Publisher :
- SAGE PUBLICATIONS LTD, 2012.
-
Abstract
- Previous comparative genomic studies of genes involved in olfactory behavior in Drosophila focused only on particular gene families such as odorant receptor and/or odorant binding proteins. However, olfactory behavior has a complex genetic architecture that is orchestrated by many interacting genes. In this paper, we present a comparative genomic study of olfactory behavior in Drosophila including an extended set of genes known to affect olfactory behavior. We took advantage of the recent burst of whole genome sequences and the development of powerful statistical tools to analyze genomic data and test evolutionary and functional hypotheses of olfactory genes in the six species of the Drosophila melanogaster species group for which whole genome sequences are available. Our study reveals widespread purifying selection and limited incidence of positive selection on olfactory genes. We show that the pace of evolution of olfactory genes is mostly independent of the life cycle stage, and of the number of life cycle stages, in which they participate in olfaction. However, we detected a relationship between evolutionary rates and the position that the gene products occupy in the olfactory system, genes occupying central positions tend to be more constrained than peripheral genes. Finally, we demonstrate that specialization to one host does not seem to be associated with bursts of adaptive evolution in olfactory genes in D. sechellia and D. erecta, the two specialists species analyzed, but rather different lineages have idiosyncratic evolutionary histories in which both historical and ecological factors have been involved. Fil: Lavagnino, Nicolas Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina Fil: Serra, François. Centro de Investigaciones Príncipe Felipe; España Fil: Arbiza, Leonardo. Centro de Investigaciones Príncipe Felipe; España Fil: Dopazo, Hernán Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina Fil: Hasson, Esteban Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
- Subjects :
- Olfactory system
Odorant binding
Drosophila sechellia
Otras Ciencias Biológicas
lcsh:Evolution
Genomics
Olfaction
gene sequence
olfactory system
adaptation
Biology
Bioinformatics
Drosophila yakuba
Genome
Drosophila melanogaster species group
Drosophila ananassae
Ciencias Biológicas
purl.org/becyt/ford/1 [https]
insect genetics
insect genome
Genetics
lcsh:QH359-425
Gene family
controlled study
insects
purl.org/becyt/ford/1.6 [https]
Gene
smelling
Ecology, Evolution, Behavior and Systematics
Original Research
arthropod life cycle stage
nonhuman
molecular evolution
article
Hexapoda
evolutionary genomics
biology.organism_classification
Computer Science Applications
Drosophila melanogaster
olfactory behavior
Evolutionary biology
evolutionary rate
Drosophila
Drosophila simulans
Drosophila erecta
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
Subjects
Details
- ISSN :
- 11769343
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- Evolutionary Bioinformatics, r-CIPF: Repositorio Institucional Producción Científica del Centro de Investigación Principe Felipe (CIPF), Centro de Investigación Principe Felipe (CIPF), Evolutionary Bioinformatics, Vol 2012, Iss 8, Pp 89-104 (2012), Evol. Bioinformatics 2011;2011(7):89-104, Biblioteca Digital (UBA-FCEN), Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, instacron:UBA-FCEN, r-CIPF. Repositorio Institucional Producción Científica del Centro de Investigación Principe Felipe (CIPF), instname, CONICET Digital (CONICET), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, instacron:CONICET
- Accession number :
- edsair.doi.dedup.....110a12561e81f559cbc591366bb33732