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Draft Genome Sequence of Tubulinosema ratisbonensis , a Microsporidian Species Infecting the Model Organism Drosophila melanogaster

Authors :
Adrien Franchet
Ivan Wawrzyniak
Sebastian Niehus
Christine Gaspin
Caroline Belser
Karine Labadie
Arnaud Couloux
Frédéric Delbac
Valérie Polonais
Eric Peyretaillade
Dominique Ferrandon
Matthieu Reichstadt
Abdel Belkorchia
Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE)
Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)
Institut für Virologie
Philipps University
Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle
Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH)
VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE)
Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
Génomique métabolique (UMR 8030)
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)
EA CIDAM - Auvergne IFR Santé
Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)
Modèles Insectes de l'Immunité Innée (M3I)
Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC)
Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Moné, Anne
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRAE)
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Institut de Biologie François JACOB (JACOB)
Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA))
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH)
VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université d'Auvergne (Clermont Ferrand 1) (UdA)
Source :
Microbiology Resource Announcements, Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (31), ⟨10.1128/MRA.00077-19⟩, Microbiology Resource Announcements, 2019, 8 (31), ⟨10.1128/MRA.00077-19⟩
Publication Year :
2019
Publisher :
HAL CCSD, 2019.

Abstract

We present the draft genome sequence of Tubulinosema ratisbonensis, a microsporidium species infecting Drosophila melanogaster. A total of 3,013 protein-encoding genes and an array of transposable elements were identified. This work represents a necessary step to develop a novel model of host-parasite relationships using the highly tractable genetic model D. melanogaster.

Subjects

Subjects :
Transposable element
[SDV]Life Sciences [q-bio]
ved/biology.organism_classification_rank.species
ORGANIZATION
ANNOTATION
03 medical and health sciences
0302 clinical medicine
Immunology and Microbiology (miscellaneous)
Tubulinosema ratisbonensis
Genetic model
Genetics
Melanogaster
Model organism
Molecular Biology
Gene
ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
030304 developmental biology
Whole genome sequencing
0303 health sciences
biology
ved/biology
Genome Sequences
biology.organism_classification
[SDV] Life Sciences [q-bio]
Drosophila melanogaster
030217 neurology & neurosurgery

Details

Language :
English
ISSN :
2576098X
Database :
OpenAIRE
Journal :
Microbiology Resource Announcements, Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (31), ⟨10.1128/MRA.00077-19⟩, Microbiology Resource Announcements, 2019, 8 (31), ⟨10.1128/MRA.00077-19⟩
Accession number :
edsair.doi.dedup.....0804bc11e988b6bcc7027b7d9463c94a
Full Text :
https://doi.org/10.1128/MRA.00077-19⟩
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