Apport de la PCR pour le diagnostic de pneumocystose en médecine et en réanimation

Introduction La pneumocystose (PCP) est une infection pulmonaire aigue dont l’incidence augmente. L’infection concerne desormais principalement des patients non infectes par le virus de l’immunodeficience humaine (VIH) exposes a divers immunosuppresseurs. Dans ce contexte, le diagnostic de PCP est difficile car la presentation clinique est atypique et l’examen direct (ED) des secretions respiratoires, gold standard diagnostique, est souvent negatif. Dans cette situation, la detection d’ADN de Pneumocystis jirovecii dans les secretions respiratoires par polymerase chain reaction quantitative en temps reel (qPCR) est un examen prometteur mais peu evalue. Materiels et methodes Afin d’evaluer l’apport diagnostique de la qPCR, tous les patients hospitalises en service de medecine ou de reanimation dans un CHU et ayant une qPCR positive dans les secretions respiratoires ont ete inclus dans une etude retrospective menee entre 2013 et 2016. A partir des donnees cliniques, du resultat de l’ED des secretions respiratoires, de l’imagerie et du traitement administre, les patients ont ete classes en trois groupes : PCP certaine, possible ou colonisation, independamment de la valeur de qPCR. Resultats Cent cinquante patients, dont 38 infectes par le VIH, ont ete inclus : 75 en medecine et 75 en reanimation. Quatre-vingt-dix patients (60 %) ont beneficie d’un lavage broncho-alveolaire. Le diagnostic de PCP etait juge certain ou possible pour respectivement 52 et 77 patients et rejete (colonisation) pour 21 patients. L’ED etait negatif pour 78 % des patients non VIH et 29 % des patients VIH. Parmi les 129 patients avec PCP, dont 97 % ont ete traites par cotrimoxazole, la mortalite hospitaliere etait de 35,9 % en reanimation et de 21,5 % en medecine. La valeur mediane de qPCR etait de 76 650 copies/mL parmi les patients avec PCP et de 3220 copies/mL parmi les patients colonises ( p Conclusion Si la qPCR s’avere, a elle seule, imparfaite pour le diagnostic differentiel entre colonisation et infection, elle a pour merite d’orienter le clinicien vers le diagnostic de PCP notamment pour les patients non VIH dont l’ED des secretions respiratoires est negatif dans pres de 80 % des cas, autant en medecine qu’en reanimation.