MOLEKÜLER VE GELENEKSEL YÖNTEMLERLE TANIMLANARAK UZUN SÜRE SAKLANMIŞ STOK CANDİDA KÖKENLERİNİN MALDI-TOF MS İLE ANALİZİ

Amac: Son yillarda Candida turlerine bagli enfeksiyon oranlarinda artis gozlenmesi ve antifungal duyarlilik sonuclarinin turlere gore farkliliklar sergilemesi gibi nedenlerle, Candida izolatlarinin hizli ve dogru bir sekilde tur duzeyinde tanimlanmasi gerekli hale gelmistir. Bu calismada, MALDI-TOF MS yonteminin, geleneksel ve molekuler yontemler ile tur duzeyinde tanimlanmis ve uzun sure -20°C’de saklanmis Candida klinik izolatlarini tanimlamadaki etkinligini arastirmak amaclanmistir. Gerec ve Yontem: Calismaya, 10 yildan daha uzun suredir -20°C’de saklanan, canlandirma islemi yapilmamis ve API® ID 32C, CHROMagar Candida ile PCR-RFLP gibi cesitli yontemlerle tanimlanmis 28 Candida izolati dahil edildi. Izolatlar yeniden pasajlandi ve MALDI-TOF MS ile analiz edildi. Daha once tur duzeyinde tanimlanamayan bir izolat ile MALDI-TOF MS skoru dusuk olan diger bir izolat ITS dizileme ile analiz edildi. Ayrica calisma izolatlarimiz ile rutin kulturlerden izole edilmis 57 Candida susuna ait MALDI-TOF MS skorlari karsilastirildi. Bulgular: MALDI-TOF MS analizinde 11 (%39,3) izolat icin tur duzeyinde ve 15 (%53,6) izolat icin cins duzeyinde guvenilir tanimlama elde edilirken, iki izolat guvenilir tanimlama sinirlarinin disinda kalmistir. Cesitli yontemlerle ile tanimlanan 28 izolatin tamaminda, MALDI-TOF MS yontemi ile farkli skorlar elde edilse de tur duzeyinde dogru tanimlama yapilmistir. Sonuc: MALDI-TOF MS uzun sure saklanmis stok Candida izolatlarinin tanimlanmasinda geleneksel ve RFLP gibi molekuler yontemler ile kiyaslandiginda kolaylikla kullanilabilecek, dusuk maliyetli, hizli ve guvenilir bir yontemdir. Calismaya alinan izolatlar sinirli sayida olmakla birlikte, MALDI-TOF MS ile yapilan analizlerde Candida turleri icin alinan dusuk skor degerlerinin tanimlamada yararli olabilecegini dusunuyoruz.