Back to Search
Start Over
Genetic diversity in V. vinifera and its impact on hosted microbiota
- Publication Year :
- 2020
- Publisher :
- Aristotle University of Thessaloniki, 2020.
-
Abstract
- �� ���������������������� ������ ���������������� ���������� ������ ������ ������ �������������������� ������ ������������������ ������������������������ �������������� �������� ����������. �� ���������������� ������������ ������ ������������������ �������������� ���� �������� ���� �������������������� �������� ���������������������������� ������ �� �������������������� ������ ���������� ������ ������������������, ������ �������������������������� ������ ������ ���������������������� ���������������������� ������ �������������� ������ ���������������������� �������������������� ������ �������������������������� ������ ���� ������������ ���������� �������������������� ������������������ ���� ���������� ���� ������ �������������� ������ ������ ����������������. �� �������������������������� ������ ������������������ �������������� ���� �������� �������������������� ���������������������������� ���������� ���������������������� �������� ������ ������ ���������������������� ������ ������ ���� ���������������������� ������������������. �������� ���� ���������������������������� �������������������� ������ ������ ������������������ ���������������� ������������ ������ ������ ���������� ���������� ������������������������ ������������������������ ������������������������ �������������� SSR. ���������� ���� �������������� ���� ������������������ ���� ������ �������������� ���������������� ���������� ������������ ������������������ (HRM) �������������������������������� ������ ���� ������������������, ���� ������������������������ ������ ���� �������������������� ������ ���������������������������� �������������������������������� ������������ �������� �������������� ���������������� ������������������ ��������������. ���� �������������� ������ ���������������������� �������� ������������������������, ������������������������ ������������������ ���������������� ���������� ������ �������������������� ���������� ���������������� ������ ��, ���� �������������������� �������� ���������������������� �������������� SSR. ����������������, �� HRM ���������������������� ������������ ������ ���� ���������������� ������ ������������������ SSR. ���� ������������������������ �������������������� ������ ���������������� ������������������ ������ ���������������������������������� ������ ������ �������������� ������������ ������ ������������������ ������ ���������������������� ���������� ������ �������������� ���������������������� ������������������������������ ������ ���� ������������������ ���� ���������������� ������ ���������������� �������������� ������ ���������������������� ������������������ ������ ������������������ �������� ���� ����������������������������. ���� �������������������� ������ �������������� �������������������� ���������������� ������ ���������������������� ������ ������ ���������������������������� ������ ���������������������� ������������������ ������ Vitis. �� ���������������� ������ ������������������ Vitis, ������ �������������������������� ������ ������ ���������������������� ���������������������� ������ �������������������������� ������ ������������������ ���� ���������� ������ ������������������ �������������������������������� ������������������������������ �������������������� ���������������� ������������ (NGS) ���� ������ �������������������� ������������������������������������ ������ ���������������� ���� �������������� 16SrRNA. ���� ������������������������ ���������������� ������ ���� �������������� �������������������� �������������� �������������������� ������ ������������������������ ���������� ����������������������������. ���� ����������������������������, ���� ������������������������ ������ ���� ���������������������������� �������� ���� ���������������� ��������. �������������������� ���������������� �������� �������������������������� ������������ ������ �������������� ������ ���������������������� �������� ������ ������ ���������� ���������������� ���������������������� ������ �� ���������������� ���������� �������������������� ���������� ������ �������������������� ��������������������������. ������ ������ �������� ������������, ���������������������� ������������������������ ������ �������������������� �������������������� ���������������������� ���� �������������������� ���������������� �������� �������������������� ������������������ �������� �������� ������������������. ���� ���������������������������������� ���������������� ���������������� �������������������������� ���������������� ������ �������� ���������������������� ������������ ������ ������������������, ������ �������������������������� ������ ������ ���������������������� ������ ������������������ ������ �������������������������� ������ ������������������ ������ ���������������������� ���� ������ ������������.<br />Grapevine is one of the economically most valuable fruit crops in the world. Discrimination among grapevines based on agronomic traits and investigation of the role of genotype along with the environment and agronomic management on the composition of bacterial communities hosted by the vine plant is highly important in relation to yield and quality. Identification of grapevine varieties based on agronomic traits is essential to selection for cultivation and in a breeding program. These traits are under a complex genetic control for which different linked SSR markers have been previously identified. These markers combined with ��igh-Resolution Melting (HRM) analysis were employed to examine, evaluate and compare the intravarietal genetic diversity among a big collection of grapevine varieties. The studied markers were highly polymorphic, displaying unique melting curves for unusually many samples than the expected in ordinary SSR analysis. Moreover, HRM proved to be powerful for distinguishing SSR genotypes. The results enable a better understanding of the variation and relationship among the studied varieties based on the markers related to agronomic traits and could provide a valuable reference for breeding programs targeting these traits. Bacterial communities in grapevines were recently reported to be influenced by Vitis cultivar and agronomic practices. The impact of Vitis cultivars, environment and agronomic management on the bacterial microbiome inhabiting those cultivars was performed using next-generation sequencing (NGS) in a metagenomics approach targeting the 16S rRNA gene. The results show that grapevines harbor a rich microbiota and display high bacterial biodiversity. Proteobacteria, Bacteroidetes and Actinobacteria were the most dominant phyla. Significant differences in diversity among the studied grapevines under the same terroir suggest that cultivar exerts selective pressure on bacterial diversity. On the other hand, different environments and agronomic management were related to significant differences in the bacterial community of a single variety. The metagenomic findings provide supportive evidence for the prevailing roles of cultivar, environment and crop management in the differentiation of Vitis associated microbiomes.
Details
- Language :
- English
- Database :
- OpenAIRE
- Accession number :
- edsair.doi...........4b95ceba013471652fa42ffdc9e94803
- Full Text :
- https://doi.org/10.26262/heal.auth.ir.325538