Практика проведения анализа производительности суперкомпьютерных задач

Предложен метод проведения анализа эффективности и оптимизации суперкомпьютерных приложений, примененный на практике для изучения задач одного из пользователей суперкомпьютера Ломоносов2. Этот метод затрагивает различные этапы исследования задач, начиная от изучения общего поведения всех запусков пользователя на суперкомпьютере и заканчивая детальным изучением и оптимизацией исходного кода выбранной программы. Приведено описание общих этапов анализа, которые были выполнены на практике, показаны метрики производительности, на которые следует обратить внимание при выполнении подобного анализа, а также продемонстрированы конкретные примеры поведения задач и эффект от оптимизации, выполненной для задачи расчета жидкокристаллических капель.
A method for the efficiency analysis and optimization of supercomputer applications applied earlier in practice to study jobs of a user on the Lomonosov2 supercomputer is proposed. This method involves various stages of the jobs research, starting from studying the general behavior of all user launches on a supercomputer and ending with a detailed study and optimization of the source code of a selected program. The paper describes the general stages of the analysis that were carried out in practice, shows performance metrics that should be paid attention to when performing such an analysis, and shows also some specific examples of the job behavior and the effect of optimization carried out for the task of calculating liquid crystal droplets.
ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЕ МЕТОДЫ И ПРОГРАММИРОВАНИЕ: НОВЫЕ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ, Выпуск 3 2019