Digital-PCR : un nouvel outil pour l’analyse des biomarqueurs de résistance aux inhibiteurs de tyrosine kinase de l’EGFR

Rationnel La resistance aux inhibiteurs de tyrosine kinase de l’EGFR (ITK-EGFR) est un axe cle de la prise en charge des cancers bronchiques non a petites cellules (CBNPC). Notre equipe a etudie les facteurs de resistance aux ITK-EGFR par des techniques conventionnelles et montre la necessite d’optimiser les techniques d’analyse qui doivent etre plus sensibles et necessiter le moins de materiel tumoral possible. La digital-PCR (dPCR) repond a ces criteres. Nous presentons une etude de faisabilite de l’analyse en dPCR des facteurs moleculaires de resistance aux ITK-EGFR. Methodes Les patients atteints de CBNPC metastatique avec mutation de l’EGFR resistants aux ITK-EGFR ont ete selectionnes. Nous avons analyse la mutation T790M de l’EGFR, l’amplification de MET et les mutations de PI3KCA par dPCR. Ces analyses ont ete mises au point sur lignees cellulaires puis realisees sur l’ADN tumoral des patients. Resultats Sur lignees cellulaires, aucune mutation n’a ete mise en evidence pour le temoin negatif et des mutations ont bien ete trouvees dans les lignees mutees. Onze patients ont ete selectionnes. Des mutations non trouvees en routine ont ete mises en evidence. Des mutations ont ete trouvees meme dans de petits echantillons. De plus, la dPCR permet une quantification de l’ADN et la recherche d’amplifications. Conclusion La dPCR est tres sensible, reproductible et permet une quantification. Elle permet de reduire la taille des echantillons, les couts et d’optimiser l’individualisation therapeutique. Cependant, nous ne connaissons pas le seuil de significativite des anomalies geniques detectees et des etudes ulterieures sont necessaires.