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Modélisation déterminisme d'un schéma de sélection avicole

Authors :
Yoannah
Nabeel Alnahhas
Sophie Brard
Herve Chapuis
Jean Michel Elsen
Pascale Le Roy
Recherches Avicoles (SRA)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Syndicats des sélectionneurs avicoles et aquacoles français (SYSAAF)
Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE )
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]
Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE)
AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Unité de Recherches Avicoles (URA)
Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français (SYSAAF)
AGROCAMPUS OUEST
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
ProdInra, Archive Ouverte
Source :
12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. 1124 p, www.itavi.asso.fr/jra/2017, HAL
Publication Year :
2017
Publisher :
HAL CCSD, 2017.

Abstract

Modeling a selection scheme enables to vary its parameters and to compare different organizations through thepredicted genetic gains. This is a useful tool for professionals. The deterministic modeling consists in estimatingthe breeder true breeding value expectation after a selection process based on estimated breeding values and onthe different parameters describing the population and the selection process. This model is based on a layerchicken selection scheme with a breeding goal composed of numerous traits. This is a two steps model thatcombines an individual selection process and a familial one. Within selected families, candidates from the goodfamilies are undergoing a mass selection whereas candidates from medium families are undergoing a withinfamily selection of a fixed number of candidates. The variability of the parameters composing the model enablesto compare a large diversity of scenarios. To illustrate the usefulness of this model, we compared differentscenarios varying for the familial selection rate: its increase leads to an increase of the predicted genetic gainuntil it reaches a plateau. An example of comparison between genetic and genomic models is also given in thisarticle, as this model can be used as a basis to explore all the possibilities brought by genomic selection.<br />Modéliser un schéma de sélection permet d’en faire varier les paramètres qui décrivent son organisation et deprédire les gains génétiques attendus afin de comparer différentes organisations. C’est un outil d’aide à ladécision très utile pour la profession. La modélisation déterministe consiste à estimer les espérances des valeursgénétiques de cohortes de reproducteurs en s’appuyant sur les valeurs génétiques estimées utilisées pour lasélection, sur les paramètres décrivant la population et le processus de sélection. Le modèle proposé se placedans le cadre d’un schéma de sélection de poules pondeuses avec un objectif incluant de nombreux caractères. Ilcombine, en deux étapes, un processus de sélection individuelle et un processus de sélection familiale, endistinguant les individus de bonnes familles qui subissent une sélection massale et ceux des famillesintermédiaires qui subissent une sélection intra-famille. L’utilité de ce modèle est illustrée par la comparaison dedifférents scénario variant par le taux de sélection familiale : son augmentation s’accompagne d’une hausse duprogrès génétique prédit jusqu’à atteindre un plateau. Ce modèle sert de base à une exploration en cours despossibilités apportées par la sélection génomique, dont un premier exemple comparant des modèles génétiques etgénomiques est donné en illustration dans cet article.

Details

Language :
French
Database :
OpenAIRE
Journal :
12èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. 1124 p, www.itavi.asso.fr/jra/2017, HAL
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..ba3a0efd1748ab7fdcadd9c4d17e60ba