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Parametric estimation of spike train statistics by Gibbs distributions : an application to bio-inspired and experimental data

Authors :
Bruno Cessac
Juan Carlos Vasquez
Hassan Roland Nasser
Horacio Rostro-Gonzalez
Thierry Viéville
Adrian Palacios
NEUROMATHCOMP
Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM)
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-INRIA Rocquencourt
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Laboratoire Jean Alexandre Dieudonné (JAD)
Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)
Neuromimetic intelligence (CORTEX)
INRIA Lorraine
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (LORIA)
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre de recherche en épistémologie appliquée (CREA)
École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS)
Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Université Nancy 2-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Université Nancy 2-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)
Source :
Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, "Neurocomp'10", Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, "Neurocomp'10", Aug 2010, Lyon, France, HAL
Publication Year :
2010
Publisher :
HAL CCSD, 2010.

Abstract

We review here the basics of the formalism of Gibbs distributions and its numerical implementation, (its details published elsewhere \cite{vasquez-cessac-etal:10}, in order to characterizing the statistics of multi-unit spike trains. We present this here with the aim to analyze and modeling synthetic data, especially bio-inspired simulated data e.g. from Virtual Retina \cite{wohrer-kornprobst:09}, but also experimental data Multi-Electrode-Array(MEA) recordings from retina obtained by Adrian Palacios. We remark that Gibbs distribution allow us to estimate the spike statistics, given a design choice, but also to compare different models, thus answering comparative questions about the neural code.

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, "Neurocomp'10", Cinquième conférence plénière française de Neurosciences Computationnelles, "Neurocomp'10", Aug 2010, Lyon, France, HAL
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..9a472088cd7a264432644d130969b857