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La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental. Synthèse de Recherche. Contrat n°1406C0050. Projet de recherche coordonné par : 'Observatoire des sols vivants'

Authors :
Bouchez , Théodore
Blieux , Anne Laure
Dequiedt , Samuel
Domaizon , Isabelle
Dufresne , Alexis
Ferreira , Stéphanie
Godon , Jean-Jacques
Hellal , Jennifer
Joulian , Catherine
Quaiser , Achim
Martin , Fabrice
Mauffret , Aourell
Monier , Jean Marie
Peyret , Pierre
Schmitt-Koplin , Philippe
Sibourg , Olivier
d’Oiron Verame , Elisabeth
Bispo , Antonio
Deportes , Isabelle
Grand , Cécile
Cuny , Philippe
Maron , Pierre-Alain
Ranjard , Lionel
Hydrosystèmes et bioprocédés (UR HBAN)
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)
Welience AgroEnvironnement
Agroécologie [Dijon]
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL)
Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO)
Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Genoscreen
Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE)
Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) (BRGM)
ENOVEO
EA CIDAM
Université Clermont Auvergne (UCA)
CRBV
Helmholtz-Zentrum München (HZM)
Observatoire Français des Sols Vivants
Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie (ADEME)
Institut Pythéas (OSU PYTHEAS)
Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
OCEAMED
n° 1406C0050
Hydrosystèmes et Bioprocédés (UR HBAN)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1)
Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Conception, Ingénierie et Développement de l'Aliment et du Médicament (CIDAM)
Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)
InfoSol (InfoSol)
Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)
Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Hydrosystèmes et bioprocédés ( UR HBAN )
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] )
Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO )
Université de Rennes 1 ( UR1 )
Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] ( LBE )
Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro )
Bureau de Recherches Géologiques et Minières (BRGM) ( BRGM )
Université Clermont Auvergne ( UCA )
Helmholtz-Zentrum München ( HZM )
Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL )
Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie ( ADEME )
Institut Pythéas ( OSU PYTHEAS )
Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Source :
ADEME Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Energie, 34 p., 2016, La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental. Synthèse de Recherche. Contrat n°1406C0050. Projet de recherche coordonné par : "Observatoire des sols vivants", ADEME Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Energie(2016)
Publication Year :
2016
Publisher :
HAL CCSD, 2016.

Abstract

EABIOmEINRA; National audience; L'étude a pour objectif de décrire les différentes techniques relevant de la microbiologie moléculaire en termes d'état d'avancement, de limites techniques et de sensibilité pour étudier l'abondance, la diversité, l'activité et les potentialités fonctionnelles des communautés microbiennes indigènes de diverses matrices environnementales (eau, sol, air, substrats déchets). On trouve dans l'étude neuf fiches de présentation des méthodes, puis vingt-neuf fiches d'application sur les milieux/substrats eau, sol, air et déchets. Des indicateurs de microbiologie moléculaire permettant un diagnostic environnemental ont été recherchés. Une trentaine d'entreprise qui les propose en routine sont données dans le rapport. Ces indicateurs microbiens sont opérationnels pour des prestations de diagnostic de la qualité de différentes matrices environnementales par différents types d'opérateurs (agriculteurs, industriels, gestionnaires de déchets, aménageurs du territoire)

Details

Language :
French
Database :
OpenAIRE
Journal :
ADEME Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Energie, 34 p., 2016, La microbiologie moléculaire au service du diagnostic environnemental. Synthèse de Recherche. Contrat n°1406C0050. Projet de recherche coordonné par : "Observatoire des sols vivants", ADEME Agence de l'Environnement et de la Maitrise de l'Energie(2016)
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..8e56550dedf52170ac47afa1f7604c54