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Developments and opportunities with Workflow4Metabolomics

Authors :
Pavot, Lain
Pétéra, Mélanie
Paulhe, Nils
Guitton, Yann
Le Corguillé, Gildas
Saint-Vanne, Julien
Tremblay-Franco, Marie
Canlet, Cécile
Martin, Jean-François
Weber, Ralf
Delporte, Cédric
Souard, Florence
Dalle, Céline
Giacomoni, Franck
LESUR, Hélène
Unité de Nutrition Humaine (UNH)
Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA)
Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments (LABERCA)
École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABIMS)
Fédération de recherche de Roscoff (FR2424)
Station biologique de Roscoff (SBR)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff (SBR)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
ToxAlim (ToxAlim)
Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Metatoul AXIOM (E20 )
MetaboHUB-MetaToul
Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim)
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan)
University of Birmingham [Birmingham]
Faculté de Pharmacie [Bruxelles] (ULB)
Université libre de Bruxelles (ULB)
Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL)
Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-ToxAlim (ToxAlim)
Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN)
Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA)
Source :
Analytics 2022, Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France
Publication Year :
2022
Publisher :
HAL CCSD, 2022.

Abstract

International audience; Metabolomics data analysis is a complex, multistep process, constantly evolving with the development of new analytical technologies, mathematical methods, bioinformatics tools and databases. Workflow4Metabolomics[1] is a collaborative portal dedicated to metabolomics data processing, analysis and annotation for the Metabolomics community. In the latest version of W4M, the core team proposes new upgrades for LC-MS, GC-MS and NMR pipelines, including new preprocessing steps, as well as enhancement of statistical analysis and annotation tools. W4M aims to promote open science in Metabolomics and facilitate knowledge dissemination by providing community resources.

Details

Language :
English
Database :
OpenAIRE
Journal :
Analytics 2022, Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..82e192937b194206f7ff6397a3ecc724