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Ligand ranking and virtual screening with the nonempirical MED model
- Source :
- RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valéncia, instname
- Publication Year :
- 2021
- Publisher :
- Universitat Politècnica de València, 2021.
-
Abstract
- [ES] Funciones no empíricas pueden usarse para la estimación de la afinidad de unión entre dos moléculas. En este estudio se estudia la clasificación de ligandos de fosfodiesterasa tipo 5 utilizando el modelo MED, estimando la afinidad de unión en base a términos electrostáticos multipolares y de dispersión aproximada, con el objetivo de validar el desempeño del modelo MED.<br />[EN] Nonempirical functions can be used for the estimation of binding affinity between two molecules. In this study, ranking of phosphodiesterase type 5 ligands was obtained using MED model, estimating the binding affinity based on multipole electrostatic and approximate dispersion terms, with the aim of validation of the MED model performance
- Subjects :
- Energía de interacción
Fosfodiesterasa tipo 5
Grado en Biotecnología-Grau en Biotecnologia
Término multipolar
Multipole electrostatic
Dispersion
Dispersión
Complejos proteína-ligando
GENETICA
Protein-ligand complexes
Binding affinity
Afinidad de unión
Phosphodiesterase-type 5
Interaction energy
Subjects
Details
- Language :
- English
- Database :
- OpenAIRE
- Journal :
- RiuNet. Repositorio Institucional de la Universitat Politécnica de Valéncia, instname
- Accession number :
- edsair.dedup.wf.001..7b95fd24f1bd946e4ea465dcd08ac768