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Acetoanaerobium pronyense sp. nov., an anaerobic alkaliphilic bacterium isolated from the Prony alkaline Hydrothermal Field in New Caledonia

Authors :
BES, Meline
Merrouch, Mériem
JOSEPH, Manon
QUEMENEUR, Marianne
Payri, Claude
Pelletier, Bernard
Ollivier, Bernard
FARDEAU, Marie-laure
Erauso, Gaël
POSTEC, Anne
Institut méditerranéen d'océanologie (MIO)
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Biocomplexité des écosystèmes coralliens de l'Indo-Pacifique (CoReUS2)
Géoazur (GEOAZUR 7329)
Université Côte d'Azur (UCA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur
Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)
Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO )
Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Biocomplexité des écosystèmes coralliens de l'Indo-Pacifique ( CoReUS2 )
Géoazur ( GEOAZUR )
Université Nice Sophia Antipolis ( UNS )
Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Observatoire de la Côte d'Azur
Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur
Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)
Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Source :
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. 〈10.1099/ijs.0.000307〉, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩
Publication Year :
2015
Publisher :
HAL CCSD, 2015.

Abstract

International audience; A novel anaerobic bacterium, strain ST07-YET, was isolated from a carbonate chimney of the Prony Hydrothermal Field (PHF) in New Caledonia. Cells were Gram-positive-staining, straight rods (0.7-0.8 x 3.0-5.0 µm). They were motile by the means of lateral flagella. Strain ST07-YET was mesophilic (optimum 35°C), moderately alkaliphilic and halotolerant (optimum pH 8.7 and 5 g l-1 NaCl). Elemental sulfur, sulfate, thiosulfate, sulfite, nitrate and nitrite were not used as terminal electron acceptors. Yeast extract, peptone, tryptone, casamino-acids, crotonate, pyruvate, galactose, maltose, sucrose, ribose, trehalose and glucose were used as carbon sources. Glucose fermentation led to acetate, H2 and CO2 formation. Arginine, serine, histidine, lysine, methionine and cysteine improved growth, but the Stickland reaction was negative for the combinations of amino acids tested. The major metabolic products from yeast extract fermentation were H2, acetate, butyrate, isobutyrate, isovalerate and propionate. The predominant cellular fatty acids were C16:0, C16:1 cis9, C14:0 and C16:1 cis7 (>5% of total fatty acids). The G+C content of the genomic DNA was 32.9 mol %. Phylogenetic analysis revealed that strain ST07-YET was most closely related to Clostridium sticklandii DSM 159T and Acetoanaerobium noterae NOT-3T (96.7% and 96.8% 16S rRNA gene sequence identity). On the basis of phylogenetic, chemotaxonomic and physiological properties, strain ST07-YET (= DSM 27512 = JCM 19400) is proposed as a novel species of the genus Acetoanaerobium, order Clostridiales, phylum Firmicutes, as Acetoanaerobium pronyense sp. nov..

Details

Language :
English
ISSN :
14665026 and 14665034
Database :
OpenAIRE
Journal :
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Microbiology Society, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. 〈10.1099/ijs.0.000307〉, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2015, pp.10.1099/ijs.0.000307. ⟨10.1099/ijs.0.000307⟩
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..71e2601b4693ab831a81deeb5ee185b6
Full Text :
https://doi.org/10.1099/ijs.0.000307.