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Fouille de données biomédicales complexes : extraction de règles et de profils génétiques dans le cadre de l'étude du syndrome métabolique

Authors :
Sandy Maumus
Amedeo Napoli
Laszlo Szathmary
Sophie Visvikis-Siest
Génétique épidémiologique et moléculaire des pathologies cardiovasculaires
Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR14-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Knowledge representation, reasonning (ORPAILLEUR)
INRIA Lorraine
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (LORIA)
Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Université Nancy 2-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
contrat de plan Etat-Région
G. Perrière
A. Guénoche
C. Gourgeon
Maumus, Sandy
G. Perrière, A. Guénoche, C. Gourgeon
Source :
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques-JOBIM 2005, Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques-JOBIM 2005, 2005, Lyon, France. pp.169-173, HAL
Publication Year :
2005
Publisher :
HAL CCSD, 2005.

Abstract

5 pages; Nous décrivons une étude sur la fouille de données de la cohorte STANISLAS qui met en œuvre l'extraction de motifs fréquents et de règles d'association. D'une part, nous avons extrait des connaissances utiles et nouvelles pour l'expert qui lui ont permis de générer de nouvelles hypothèses de recherche en biologie. D'autre part, ces travaux nous ont conduit à proposer les premiers éléments d'une méthodologie de fouille de règles extraites en bioinformatique. Au cœur de ces réflexions, nous soulignons le rôle majeur de l'expert dans le processus de fouille de données. Les résultats obtenus sont satisfaisants et illustrent le potentiel des méthodes symboliques de fouille de données en biologie.

Details

Language :
French
Database :
OpenAIRE
Journal :
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques-JOBIM 2005, Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques-JOBIM 2005, 2005, Lyon, France. pp.169-173, HAL
Accession number :
edsair.dedup.wf.001..502891702a7c8402ecb03256716076aa