Meme kanserinde BRCA-1 ve BRCA-2’de sık görülen nokta mutasyonların (polimorfizm) bölgemizde görülme sıklığı

Giriş ve Amaç: Meme kanseri dünyada kadınlar arasında en sık görülen malign tümör olup, tüm kadın kanserlerinin yaklaşık %25’ini oluşturmaktadır. Her yaş grubunda görülebilmesine karşın genç yaşta ailesel olguların dışında nadir olarak görülmektedir. BRCA 1, 2 mutasyonları, nokta mutasyonlarından dolayı oluşan meme kanserlerinin çoğunluğunu ve genel meme kanserlerinin %3’ünden sorumlu tutulmaktadır. BRCA 1 ve BRCA 2 genlerinde kodlama bölgeleri boyunca dağılan yüzlerce farklı mutasyon bildirilmiştir. Biz çalışmamızda meme kanserinde genetik yatkınlığı belirlemek için sık olarak tespit edilen BRCA 1 (rs16942, rs1799966) ve BRCA 2 (rs144848, rs1799944) genlerine ait polimorfik nokta mutasyonlarının bölgemizdeki sıklığını PCR özgül belirleme grubundan Hibridizasyon Prob Yöntemiyle “LightCycler” PCR cihazı kullanılarak belirlemeyi ve bu mutasyon oranlarının ER pozitifliği, HER 2 durumu, Evre , Grade ve yaş ile ilişkili olup olmadığını saptamayı amaçladık. Materyal ve Metod: Araştırmamızda Dicle Üniversitesi Tıp fakültesi Onkoloji Bilim Dalında genç yaş (44 yaş altı) grubu kadınlarda meme kanseri tanısı almış 96 adet hasta çalışmaya alındı. Parafine gömülü tümör dokulardan genomik DNA izolasyonu yapıldı ve DNA saflığı ile konsantrasyonu yapıldı. Sonra bu tüplerden BRCA 1 ve BRCA 2 genlerindeki polimorfizm mutasyonları Real-Time PCR ile belirlendi. Ülkemizde yapılmış çalışmalardan en sık saptanmış olan 4 nokta mutsayonu çalışmada değerlendirildi. Bu hastalara ait yaş, grade, ER, HER- 2 reseptör durumu ve Evre gibi parametreler çıkarıldı. SPSS 21.0 bilgisayar programı kullanılarak çalışmanın istatiksel değerlendirilmesi yapıldı. p≤0.05 istatiksel olarak anlamlı kabul edildi. Bulgular: Çalışmamızda elde ettiğimiz verilere göre 96 olgumuzdan BRCA 1 genine ait rs16942 de 14 (%14.5) adet homozigot (GG), 55 (%57.3) adet heterozigot (AG); rs1799966 da 18 (%18.75) adet homozigot (GG) 46 (%47.9) adet heterozigot (AG); BRCA 2 genine ait rs144848 de 9 (%9.37) adet homozigot (TT), 25 (%26.04) adet heterozigot (GT); rs1799944 de 2 (%2.08) adet homozigot (GG), 3 (%3.12) adet heterozigot (AG) hastada nokta mutasyonu saptadık. Bu oranların ülkemizin diğer bölgelerinde yapılmış çalışma oranlarından biraz yüksek olduğu görüldü. Bu nokta mutasyonları ile; Grade ilişkisi karşılaştırıldığında ortalama p değeri 0.464, ER pozitifliği ile karşılaştırıldığında ortalama p değeri 0.647, .HER 2 pozitifliği ile karşılaştırıldığında ortalama p değeri 0.833, 35 yaş üstü hastalarla kıyaslandığında ise ortalama p değeri 0.358 olarak bulundu. Sonuç: Bölgemizde BRCA 1-2 deki polimorfizm mutasyon oranları yüksek sıklıkta görülmektedir. Bu nedenle de bölgemiz de erken yaşta meme kanser li vakalara ve aile bireylerine genetik taramaların yapılması gereklidir. Anahtar Kelimeler: BRCA-1; BRCA-2; meme kanseri; nokta mutasyon, polimorfizm, LightCycler PCR Introduction: Breast cancer, the most frequent malign tumor in the world, constitutes approximately 25% of all women cancers. Although it can be seen in all age groups, breast cancer, except familial cases rarely seen at an early age. BRCA 1,2 mutations are held responsible for the most of breast cancers, develop due to point mutations and 3% of overall breast cancers. Hundreds of different mutations are reported in BRCA 1 and BRCA 2 genes spreading throughout the decoding zones.In our research, we aim to designate the frequency of polymorphic point mutations belonging to BRCA 1 (rs16942, rs1799966) and BRCA 2 (rs144848, rs1799944) genes in our region , ascertained frequently, in order to identify genetic susceptibility in breast cancer by using the "LightCycler" PRC device with the method of Hibridization Prob from the group of PRC specific identification and determine the relationship of those mutation rates with ER positive, the state of HER 2 , stage, grade and age. Materials and Method: In our research 96 patients, diagnosed breast cancer among the young women group (under the age of 44) are taken to the study in Diyarbakır Dicle University, Faculty of Medicine -Departman of Oncology. Genomic DNA isolation from the the paraffin-embedded tumor tissues is done and DNA purity and concentarion is held. Then polymorphism mutations in BRCA 1 and BRCA 2 genes from those test tubes are defined with Real -Time PRC. Four points mutation , the most frequent one which is confirmed in researches in our country is evaluated in our research. Some parameters are assigned as age, grade, ER, the state of HER 2 and stage belongig to those patients. Statistical evaluation of the reseach is practiced by using SPSS 21.0 computer programme. p≤0.05 is accepted meaningful statistically. Results: According to the data aquired from our study we found out 14(14,5%) homozygotes (GG), 55(57,3%) heterozygotes(AG) in rs16942; 18(18,75%) homozygotes(GG), 46(47,9%)heterozygotes (AG) in rs1799966 belong to BRCA1 gene; 9(9,37%) homozygotes (TT), 25(26,04%) heterozygotes (GT) in rs144848; 2(2,08%) homozygotes (GG), 3(3,12%) heterozygotes (AG) in rs1799944 belong to BRCA 2 gene, point muations among the patients out of 96 cases. These rates are higher than the study rates made in other regions in our country. It is found out that when comparing point mutations and Grade relation, aproximate p value is 0.464 , when comparing point mutations and ER positiveness aproximate p value is 0.647 and when comparing point mutations and HER 2 positiveness p value is 0.358. Conclusion: In our region the rate of polymorphism mutations in BRCA 1-2 is seen in high-frequency. For this reason it is essential to make a genetic screening to the early aged-cancerous patients and their family members. Key Words: BRCA-1 BRCA-2; breast cancer; point mutation, polymorphism, LightCycler PCR.