Modificación dirigida de la microbiota intestinal utilizando un anticuerpo policlonal contra la capa S de Lactobacillus acidophilus DSM20079T

Trabajo presentado en la 13ª Reunión de la Red Española de Bacterias Lácticas (RedBAL), celebrada en Madrid (España) del 17 al 18 de junio de 2019
Durante los últimos diez años ha habido avances en la compresión de cómo la microbiota intestinal humana contribuye a nuestra salud y enfermedad. La microbiota humana, especialmente la microbiota intestinal, es considerada un “órgano esencial” debido a que las comunidades microbianas que colonizan todas las superficies de nuestro cuerpo nos proporcionan funciones metabólicas, inmunológicas y fisiológicas esenciales. Tras el nacimiento, nuestra microbiota intestinal alcanza su configuración final a la edad de 2 a 3 años con la introducción de alimentos sólidos, estableciéndose una comunidad de microorganismos dominada por anaerobios obligados. Después del nacimiento, alrededor de 100 especies bacterianas colonizan el intestino, aumentando hasta 103 en la edad adulta. Su composición evoluciona constantemente, dependiendo de factores internos y externos como la edad, la raza, la dieta, la colonización materna, así como la exposición a antibióticos y xenobióticos. Además, otros factores como el estrés o los tratamientos farmacológicos conducen a rápidos cambios en la composición de nuestra microbiota. La complejidad de la microbiota intestinal hace difícil deducir la contribución individual de una especie/cepa a un fenotipo, enfermedad o condición. Por ello, el desarrollo de métodos para la modificación dirigida de una microbiota, especialmente enfocada en eliminar de una comunidad microbiana una bacteria específica, podría ser útil para descifrar como una especie contribuye a una enfermedad o a un proceso fisiológico, inmunológico o metabólico. En este estudio presentamos una tecnología que, si bien no es desconocida, sí que es pionera en cuanto a su aplicación. Hemos utilizado un anticuerpo policlonal dirigido a la proteína A de la capa S de Lactobacillus acidophilus DSM20079T para conseguir detectarlo en un consorcio bacteriano compuesto de 8 especies representativas de la microbiota intestinal humana. Además, se ha realizado una depleción y enriquecimiento positivo (y por lo tanto un aislamiento de esta bacteria del resto de especies microbianas) tanto en una microbiota sintética como en microbiotas reales. La depleción de L. acidophilus del resto de especies se realiza en un solo paso, mientras que para el enriquecimiento positivo de esta especie fue necesario el uso de tripsina ya que L. acidophilus interacciona con otras bacterias de su entorno a través de interacciones proteínaproteína u otros potenciales receptores presentes en bacterias como Akkermansia muciniphila. Esta técnica contribuirá a comprender las contribuciones específicas de una sola bacteria dentro de una microbiota intestinal humana compleja.
AGL2016-78311-R