Identification of a major gene and RAPD markers for yellow seed coat colour in Brassica napus.

The development of yellow-seeded Brassica napus for improving the canola-meal quality characteristics of lower fibre content and higher protein content has been restricted because no yellow-seeded forms of B. napus exist, and their conventional development requires interspecific introgression of yellow seed coat colour genes from related species. A doubled-haploid (DH) population derived from the F[sub 1] generation of the cross 'Apollo' (black-seeded) × YN90-1016 (yellow-seeded) B. napus was analysed via bulked segregant analysis to identify molecular markers associated with the yellow-seed trait in B. napus for future implementation in marker-assisted breeding. A single major gene (pigment 1) flanked by eight RAPD markers was identified co-segregating with the yellow seed coat colour trait in the population. This gene explained over 72% of the phenotypic variation in seed coat colour. Further analysis of the yellow-seeded portion of this DH population revealed two additional genes favouring 'Apollo' alleles, explaining 11 and 8.5%, respectively, of the yellow seed coat colour variation. The data suggested that there is a dominant, epistatic interaction between the pigment 1 locus and the two additional genes. The potential of the markers to be implemented in plant breeding for the yellow-seed trait in B. napus is discussed.Key words: Brassica napus, yellow seed, RAPD.Le développement de Brassica napus à graines jaunes, une caractéristique qui se traduit par un tourteau de canola de meilleure qualité ayant une teneur plus faible en fibres et plus élevée en protéines, est rendu difficile du fait de l'absence de B. napus à graines jaunes. En conséquence le développement par voie conventionnelle d'un tel matériel nécessite le recours à une introgression interspécifique des gènes conférant la couleur jaune aux graines. Une population d'haploïdes doublés (HD), dérivée de la génération F[sub 1] d'un croisement entre 'Apollo' (à graines noires) et YN90-1016 (à graines jaunes), a été analysée par la méthode des ségrégants regroupés (BSA) afin d'identifier des marqueurs moléculaires associés à la couleur jaune des graines chez le B. napus en vue d'éventuellement pratiquer la sélection assistée. Un gène majeur unique (pigment 1), bordé de huit marqueurs RAPD, a montré une co-ségrégation avec la couleur des graines au sein de cette population. Ce gène permet d'expliquer plus de 72 % de la variation phénotypique pour la couleur des graines. Des analyses additionnelles réalisées uniquement sur les lignées HD à graines jaunes ont révélé deux gènes additionnels favorisant les allèles du cv. Apollo, lesquels expliquaient 11 % et 8,5 %, respectivement, de la variation pour la couleur jaune. Ces données suggèrent qu'il existe une interaction épistatique dominante entre le locus pigment 1 et deux gènes additionnels. L'utilité potentielle des marqueurs pour des fins de sélection de la couleur des graines chez le B. napus est discutée.Mots clés : Brassica napus, graines jaunes, RAPD.[Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]